RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	AHT1	P29589	182 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	SDH4	P37298	181 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	MIX23	P38162	196 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	RPB11	P38902	120 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	TVP23	P38962	199 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	NSE4	P43124	402 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	TDA4	P47153	279 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	UBR1	P19812	1950 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	ERV15	P38312	142 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	NSG1	P38837	291 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	HPA3	P39979	161 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	GAT4	P40569	121 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	PGU1	P47180	361 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	GEP7	P53171	287 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YNR062C	P53748	327 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	WSC2	P53832	503 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YOL014W	Q08110	124 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	MCP1	Q12106	302 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	TIM22	Q12328	207 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	TRP1	P00912	224 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	COX9	P07255	59 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	MRS4	P23500	304 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	ERG2	P32352	222 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	SRB6	P32570	121 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	MSA2	P36157	363 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	OM14	P38325	134 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YER188W	P40103	239 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	GTT1	P40582	234 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	SNO3	P43544	222 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YFL019C	P43576	117 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	GON7	P46984	123 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	PAU12	P53343	120 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	PIR1	Q03178	341 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	ELP6	Q04868	273 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	NDD1	Q08887	554 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	PST1	Q12355	444 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	SGA1	P08019	549 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	COX10	P21592	462 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	PAU24	P38155	120 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	SFT2	P38166	215 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	SHE1	P38200	338 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YAR029W	P39549	74 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	NCA3	P46955	337 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YJL028W	P47062	111 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	SAY1	P53324	424 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	EST3	Q03096	181 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YMR252C	Q04814	134 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	UPS1	Q05776	175 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	MSB2	P32334	1306 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	MRP17	P28778	131 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	PAU2	P32612	120 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YHR130C	P38834	111 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YEL073C	P39974	107 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	PHS1	P40857	217 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	SYS1	P41544	203 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YGL262W	P53054	175 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	DOC1	P53068	250 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	EMC4	P53073	190 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YPL039W	Q03080	316 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	ATG41	Q12048	136 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	ATO3	Q12359	275 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	HAP3	P13434	144 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	RPB5	P20434	215 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	BET1	P22804	142 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	SCM4	P32564	187 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	TEM1	P38987	245 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	SPC25	P40014	221 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAM18	YLR008C	CUP9	P41817	306 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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