RNA–Protein interactions for RNA: YHR178W

STB5, Transcript of Transcription factor, yeast

Gene STB5, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB5	YHR178W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
STB5	YHR178W	YNR064C	P53750	290 aa		5.03	□□□□□ -1.6
STB5	YHR178W	MIX17	Q03667	156 aa		5.03	□□□□□ -1.6
STB5	YHR178W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
STB5	YHR178W	IMP1	P28627	190 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YNL092W	P53934	400 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	CRZ1	P53968	678 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YPR098C	Q06089	161 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	OPI10	Q08202	246 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	TIM18	Q08749	192 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	PIN2	Q12057	282 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YPS3	Q12303	508 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	ISD11	Q6Q560	94 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YPL229W	Q99395	206 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	SHR5	P41912	237 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	ATP19	P81451	68 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	TRS23	Q03784	219 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YLR296W	Q05898	108 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	COX10	P21592	462 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	REC104	P33323	182 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YPT10	P38146	199 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YJR115W	P47152	169 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	TOM7	P53507	60 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YMR210W	Q03649	449 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YOR304C-A	O14468	76 aa		5	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	INO4	P13902	151 aa		5	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	PET8	P38921	284 aa		5	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YFR045W	P43617	309 aa		5	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	IRA2	P19158	3079 aa		5	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	ROX3	P25046	220 aa		5	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YPS1	P32329	569 aa		5	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YFL065C	P43539	102 aa		5	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YPI1	P43587	155 aa		5	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		5	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YDL218W	Q07629	317 aa		5	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	MSA1	Q08471	629 aa		5	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YPR203W	Q08994	102 aa		5	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	URK1	P27515	501 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YHR173C	P38864	112 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YJR096W	P47137	282 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	PCP1	P53259	346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	EOS1	P53938	366 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YML079W	Q03629	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	ATG33	Q06485	197 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	IRC25	Q07951	179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YCR023C	P25351	611 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	MOH1	P38191	138 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YJL213W	P40896	331 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	GEP3	Q08622	556 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	FIT2	Q08906	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	LST8	P41318	303 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	OST2	P46964	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	DOG2	P38773	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	MRX11	Q03079	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	DGA1	Q08650	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	CYC3	P06182	269 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	MDM10	P18409	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	YEL067C	P39978	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	SUR7	P54003	302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB5	YHR178W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	EGT2	P42835	1041 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	CIS3	P47001	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	WSC3	Q12215	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	JID1	Q12350	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	VPS63	O13549	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	HEM4	P06174	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	CPT1	P17898	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	DUT1	P33317	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YKR032W	P36127	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	CSH1	P38287	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	HPF1	Q05164	967 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
STB5	YHR178W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	TOA2	P32774	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YKL044W	P36092	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	ICS2	P38284	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	MST28	P39552	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	UBC13	P52490	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	PHO85	P17157	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YOX1	P34161	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YHR130C	P38834	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	RAF1	Q06891	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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