RNA–Protein interactions for RNA: YHR060W

VMA22, Transcript of Protein that is required for vacuolar H+-ATPase (V-ATPase) function, yeast

Gene VMA22, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA22	YHR060W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	DDI2	P0CH63	225 aa		2.88	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	DDI3	P0CH64	225 aa		2.88	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	NMT1	P14743	455 aa		2.88	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	MRS4	P23500	304 aa		2.88	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	SAE3	P89114	91 aa		2.88	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	UPS1	Q05776	175 aa		2.88	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	INO4	P13902	151 aa		2.87	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	ETR1	P38071	380 aa		2.87	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	YGR269W	P40326	108 aa		2.87	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	FLX1	P40464	311 aa		2.87	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	PHS1	P40857	217 aa		2.87	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	AIM36	Q03798	255 aa		2.87	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		2.87	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	CSI2	Q08054	341 aa		2.87	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		2.87	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	COX8	P04039	78 aa		2.86	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		2.86	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	DIE2	P50076	525 aa		2.86	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	TVP18	Q04767	167 aa		2.86	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	SML1	Q04964	104 aa		2.86	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	LDB18	Q07887	179 aa		2.86	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	YDL157C	Q12082	118 aa		2.86	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	MDM35	O60200	86 aa		2.85	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	SFT2	P38166	215 aa		2.85	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	MET31	Q03081	177 aa		2.85	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	MIX17	Q03667	156 aa		2.85	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	KEI1	Q06346	221 aa		2.85	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	RAF1	Q06891	181 aa		2.85	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	ANB1	P19211	157 aa		2.84	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	RPB11	P38902	120 aa		2.84	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	YEL067C	P39978	195 aa		2.84	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	TMA23	Q03525	211 aa		2.84	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
VMA22	YHR060W	MSB2	P32334	1306 aa		2.84	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	STF2	P16965	84 aa		2.83	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	UTR5	P32630	166 aa		2.83	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	FYV7	Q12247	151 aa		2.83	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	YDL012C	Q12489	107 aa		2.83	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	YCR050C	P25630	102 aa		2.82	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	TRS20	P38334	175 aa		2.82	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	HUT1	Q12520	339 aa		2.82	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	SPP41	P38904	1435 aa		2.82	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	MRPL44	P19956	98 aa		2.81	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	IRC19	Q07843	230 aa		2.81	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	SNT2	P53127	1403 aa		2.81	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	MPM1	P40364	252 aa		2.8	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	YDL241W	Q07738	123 aa		2.8	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	HRT1	Q08273	121 aa		2.8	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	FIT2	Q08906	153 aa		2.8	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	PEP8	P40335	379 aa		2.79	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	GAT4	P40569	121 aa		2.79	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	YHL042W	P38729	150 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	HPA3	P39979	161 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	SOM1	Q05676	74 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	YOR385W	Q08909	290 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	RTR2	Q12378	196 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VMA22	YHR060W	HSL1	P34244	1518 aa		2.78	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	RPB7	P34087	171 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	YAL064W	P39711	94 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	CWC27	Q02770	301 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	YPR153W	Q06537	140 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	QCR10	P37299	77 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	YCL001W-A	P87012	153 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	ELP6	Q04868	273 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	YLR042C	Q07990	161 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	NAT5	Q08689	176 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	FLO9	P39712	1322 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	FYV5	P25585	152 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	ECM31	P38122	312 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	DAN1	P47178	298 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	RGM1	Q00453	211 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	YGL230C	P53074	147 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	RCE1	Q03530	315 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	COX5B	P00425	151 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	YCR099C	P25657	155 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	NRG2	P38082	220 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	YEL014C	P39999	101 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
VMA22	YHR060W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		2.72	□□□□□ -1.97

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