RNA–Protein interactions for RNA: YFL018C

LPD1, Transcript of Dihydrolipoamide dehydrogenase, yeastyeast

Gene LPD1, Length 1,500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPD1YFL018C YAL063C-AQ3E791 96 aa6.72□□□□□ -1.33
LPD1YFL018C YFL041W-AQ3E817 63 aa6.72□□□□□ -1.33
LPD1YFL018C MST28P39552 234 aa6.71□□□□□ -1.33
LPD1YFL018C YNL200CP40165 246 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
LPD1YFL018C CUP9P41817 306 aa6.71□□□□□ -1.33
LPD1YFL018C YFR057WP43625 151 aa6.71□□□□□ -1.33
LPD1YFL018C UBC9P50623 157 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
LPD1YFL018C YPL039WQ03080 316 aa6.71□□□□□ -1.33
LPD1YFL018C VPS63O13549 108 aa6.71□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C PHO85P17157 305 aa6.71□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C TIM23P32897 222 aa6.71□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C BRP1P53194 125 aa6.71□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C TPC1P53257 314 aa6.71□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C NCE103P53615 221 aa6.71□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C MIX17Q03667 156 aa6.71□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C KTI11Q3E840 82 aa6.71□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C CDC39P25655 2108 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YLL053CP0CD98 152 aa6.7□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C RFA3P26755 122 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C ERG2P32352 222 aa6.7□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C PRS4P38063 326 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C ECM34P38728 170 aa6.7□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C LCB3P47013 409 aa6.7□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C ERG13P54839 491 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C RRG8Q06109 277 aa6.7□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C RDL2Q08742 149 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YDL211CQ12121 372 aa6.7□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C MPD1Q12404 318 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C ERV1P27882 189 aa6.69□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YKL044WP36092 106 aa6.69□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YNL194CP40169 301 aa6.69□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C RHO5P53879 331 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C FLO9P39712 1322 aa6.69□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C CYT1P07143 309 aa6.68□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C QRI5P32344 111 aa6.68□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C IML3P38265 245 aa6.68□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YIL163CP40448 117 aa6.68□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C KNH1P50112 268 aa6.68□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YDR215CQ12240 137 aa6.68□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YKL183C-AQ3E765 70 aa6.68□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C SPC29P33419 253 aa6.67□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YKR041WP36134 250 aa6.67□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YER181CP40097 107 aa6.67□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C BRR6P53062 197 aa6.67□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C CPD1P53314 239 aa6.67□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YMR007WQ03675 126 aa6.67□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C CYR1P08678 2026 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YSR3P23501 404 aa6.66□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C FUB1P25659 250 aa6.66□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YGR269WP40326 108 aa6.66□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YNR071CP53757 342 aa6.66□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C AQR1P53943 586 aa6.66□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C RFM1Q12192 310 aa6.66□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YMR320WQ04897 101 aa6.66□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C YOR029WQ12243 111 aa6.66□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C CSR2Q12734 1121 aa6.66□□□□□ -1.34
LPD1YFL018C SDS23P53172 527 aa6.65□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C COF1Q03048 143 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YLR042CQ07990 161 aa6.65□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C FCY1Q12178 158 aa6.65□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C VMA3P25515 160 aa6.64□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C RPP1P38786 293 aa6.64□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YFR020WP43600 232 aa6.64□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YOR292CQ08743 309 aa6.64□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C DFM1Q12743 341 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C TIM12P32830 109 aa6.63□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C OM14P38325 134 aa6.63□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C DSK2P48510 373 aa6.63□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YIL014C-AQ02598 104 aa6.63□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C RAF1Q06891 181 aa6.63□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YLR412C-AQ3E742 68 aa6.63□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C HTL1Q9URQ5 78 aa6.63□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C APS1P35181 156 aa6.62□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YPL073CP40323 161 aa6.62□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C COX12Q01519 83 aa6.62□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YMR103CQ04436 120 aa6.62□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C MCH4Q08268 501 aa6.62□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C DAD1Q12248 94 aa6.62□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YCL021W-AQ96VH3 125 aa6.62□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C REC114P32841 428 aa6.61□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C TOM6P33448 61 aa6.61□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C MRPS5P33759 307 aa6.61□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C PCL5P38794 229 aa6.61□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C MSA1Q08471 629 aa6.61□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C BOL1Q3E793 110 aa6.61□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YCR050CP25630 102 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YPS1P32329 569 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data6.6□□□□□ -1.35not detected
LPD1YFL018C SRX1P36077 127 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YHL042WP38729 150 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C GGC1P38988 300 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C TIM17P39515 158 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C HST4P53688 370 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C MRX11Q03079 207 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 76.8 ms