RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C FIP1P45976 327 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C RPA43P46669 326 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MIC27P50945 234 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C DUO1P53168 247 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C CPD1P53314 239 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C CAB4P53332 305 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C FMP41P53889 259 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YMR181CQ03231 154 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C TMA23Q03525 211 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SDH7Q04401 133 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C AVO2Q04749 426 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C ATP14Q12349 124 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C COX19Q3E731 98 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YBR126W-AQ8TGU7 68 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C CYC3P06182 269 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YHR213WP0CI67 198 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C CPR1P14832 162 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C POP5P28005 173 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C ALK2P32789 676 aaPredicted RBP1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C RPL14AP36105 138 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C RPL14BP38754 138 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PET100P38958 111 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YNL194CP40169 301 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C POR2P40478 281 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SAS2P40963 338 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SMD3P43321 101 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SNN1P48232 102 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C DSK2P48510 373 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C RIB4P50861 169 aaPredicted RBP1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C HST4P53688 370 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C CAF40P53829 373 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C ERV25P54837 211 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C ODC1Q03028 310 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SDO1Q07953 250 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C TIM18Q08749 192 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PRM3Q08931 133 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SME1Q12330 94 aaPredicted RBP1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C VMA9Q3E7B6 73 aa1.7□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C BPH1P25356 2167 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C ADH2P00331 348 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C TDH1P00360 332 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C HHF1P02309 103 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YHR212W-AP0CX91 67 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C HSP12P22943 109 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C LDS1P31379 325 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C ACP1P32463 125 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C ECM25P32525 599 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C RPS0AP32905 252 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C TIR2P33890 251 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C RIB5P38145 238 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SFT2P38166 215 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C LSM2P38203 95 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C TRS20P38334 175 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SNF11P38956 169 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C GLE2P40066 365 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C LOC1P43586 204 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MCM22P47167 239 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C CAX4P53223 239 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PAU4P53427 120 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C OCA2P53949 197 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C ATC1Q04005 294 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PBA1Q05778 276 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C ATG39Q06159 398 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C LDS2Q08218 356 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C FIT2Q08906 153 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YPR013CQ12145 317 aa1.69□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C COX2P00410 251 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PAU1P0CE88 120 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PAU14P0CE89 120 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PAU6P0CE90 120 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PAU18P0CE91 120 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PAU8P0CE92 120 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PAU11P0CE93 120 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C DDI2P0CH63 225 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C DDI3P0CH64 225 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C RNA15P25299 296 aaPredicted RBP1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MIG1P27705 504 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C HMX1P32339 317 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SRB6P32570 121 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C UTR5P32630 166 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C YBR144CP34215 104 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C CMC1P36064 111 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PAU13P38725 120 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C IMP2P46972 177 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C LCB3P47013 409 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C UBC7Q02159 165 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PAU10Q03050 120 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MRX11Q03079 207 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C RRG8Q06109 277 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C LOA1Q06508 300 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PAU20Q08322 120 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PAU9Q3E770 120 aa1.68□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MRS1P07266 363 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C RPB3P16370 318 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SEC59P20048 519 aa1.67□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C ECM33P38248 429 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
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