RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W PTH1P38876 190 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W YIL165CP40446 119 aa4.37□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W YGR164WP53291 111 aa4.37□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W KSH1Q8TGJ3 72 aa4.37□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W IGO2Q9P305 131 aa4.37□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W YCR050CP25630 102 aa4.36□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W RFM1Q12192 310 aa4.36□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W YAL063C-AQ3E791 96 aa4.36□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W YBR292CP38357 123 aa4.36□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W YDR209CQ03480 137 aa4.36□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W DAD1Q12248 94 aa4.36□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W FKS1P38631 1876 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W PAU24P38155 120 aa4.35□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W YFR054CP43622 192 aa4.35□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W DSK2P48510 373 aa4.35□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W RIM9Q04734 239 aa4.35□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W YFL041W-AQ3E817 63 aa4.35□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W FLO5P38894 1075 aa4.35□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W YMR317WQ04893 1140 aa4.34□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W MSA1Q08471 629 aa4.34□□□□□ -1.71
CYK3YDL117W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data4.34□□□□□ -1.72not detected
CYK3YDL117W GPX1P36014 167 aa4.34□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YHR140WP38842 239 aa4.34□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W MBB1P39534 108 aa4.34□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YMR252CQ04814 134 aa4.34□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YLR296WQ05898 108 aa4.34□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W CTF8P38877 133 aa4.33□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W ROT1Q03691 256 aa4.33□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa4.33□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YCL021W-AQ96VH3 125 aa4.33□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W TES1P41903 349 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W HST4P53688 370 aa4.33□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W GAT3Q07928 141 aa4.33□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PAU1P0CE88 120 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PAU14P0CE89 120 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PAU6P0CE90 120 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PAU18P0CE91 120 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PAU8P0CE92 120 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PAU11P0CE93 120 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YOL162WP0CF19 215 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PAU13P38725 120 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W ECM34P38728 170 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W GPI2P46961 280 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PAU4P53427 120 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PAU10Q03050 120 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W FSH2Q05015 223 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YLR281CQ05863 155 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W HPA2Q06592 156 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W IRC25Q07951 179 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PAU20Q08322 120 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PAU9Q3E770 120 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W TOM6P33448 61 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W SMP1P38128 452 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W GPI18P38211 433 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W IGO1P53897 168 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa4.32□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W RPL30P14120 105 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W NRG2P38082 220 aa4.31□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W ARC40P38328 384 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W SVP26P38869 228 aa4.31□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W SNF11P38956 169 aa4.31□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PAU12P53343 120 aa4.31□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W BSC1Q12140 328 aa4.31□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YDL180WQ12301 547 aa4.31□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W ODC2Q99297 307 aa4.31□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W RIM15P43565 1770 aa4.31□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W MRP21P38175 177 aa4.31□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PAU2P32612 120 aa4.3□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W SDS23P53172 527 aa4.3□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W CPD1P53314 239 aa4.3□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W SHH4Q06236 168 aa4.3□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YPR064WQ12492 139 aa4.3□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W RNQ1P25367 405 aa4.3□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YIL169CP40442 995 aa4.3□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W ATP23P53722 227 aa4.3□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W IES4Q08561 116 aa4.3□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YOR292CQ08743 309 aa4.3□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W PCL9Q12477 304 aa4.3□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W HKR1P41809 1802 aa4.3□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YAR068WP39564 161 aa4.29□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W OST1P41543 476 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W TIS11P47977 285 aa4.29□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W HEM2P05373 342 aa4.29□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YHL042WP38729 150 aa4.29□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W POP3P53833 195 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YDR042CQ03205 200 aa4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.4 ms