RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 SUCLG2Q96I99 432 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-204ENST00000542443 CCDC144AA2RUR9 1427 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 ABCC5O15440 1437 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 KIF15Q9NS87 1388 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 ZNF185O15231 689 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 DNAJB5O75953 348 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 GNAI2P04899 355 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 FCER1AP12319 257 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 PIK3CBP42338 1070 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 FAM189BP81408 668 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 CNGA2Q16280 664 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 USP37Q86T82 979 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 PDPRQ8NCN5 879 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 PHKBQ93100 1093 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
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TRDN-204ENST00000542443 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.08□□□□□ -1.44
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TRDN-204ENST00000542443 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.07□□□□□ -1.44
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TRDN-204ENST00000542443 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 CCDC78A2IDD5 438 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 LPXNO60711 386 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 THP07101 528 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 BRAFP15056 766 aa6.07□□□□□ -1.44
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TRDN-204ENST00000542443 RALBP1Q15311 655 aa6.07□□□□□ -1.44
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TRDN-204ENST00000542443 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 STK32BQ9NY57 414 aa6.07□□□□□ -1.44
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TRDN-204ENST00000542443 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 PTPRGP23470 1445 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 CEP170Q5SW79 1584 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GTW7 788 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 BTN3A1O00481 513 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 NCR1O76036 304 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 FDXRP22570 491 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 TM4SF4P48230 202 aa6.06□□□□□ -1.44
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TRDN-204ENST00000542443 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.06□□□□□ -1.44
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TRDN-204ENST00000542443 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.06□□□□□ -1.44
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TRDN-204ENST00000542443 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 SIK2Q9H0K1 926 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 ERCC6Q03468 1493 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-204ENST00000542443 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.06□□□□□ -1.44
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