RNA–Protein interactions for RNA: YOR343W-B

YOR343W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YOR343W-B, Length 5,313 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR343W-BYOR343W-B IPI1P38803 334 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B PIR5P46999 287 aa1.3□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B BAT2P47176 376 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B DAN1P47178 298 aa1.3□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B GAS3Q03655 524 aa1.3□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B PDR18P53756 1333 aa1.3□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B DRS2P39524 1355 aa1.3□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B FUN14P18411 198 aa1.3□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B FIG1P38224 298 aa1.3□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B HSP10P38910 106 aa1.3□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B YNL033WP53964 284 aa1.3□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B SNO1Q03144 224 aa1.3□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B DER1P38307 211 aa1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B RGM1Q00453 211 aa1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B COF1Q03048 143 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B NSP1P14907 823 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B GPI14P47088 403 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B RAV2Q03956 351 aa1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B SAE3P89114 91 aa1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B RUB1Q03919 77 aa1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B MRP49P32388 137 aa1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B ARL3Q02804 198 aa1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B NMA1Q06178 401 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B RAD28Q12021 506 aa1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B PET20Q99373 253 aa1.29□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B YPR170W-BP0C5R9 85 aa1.28□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B HPA2Q06592 156 aa1.28□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B GEP7P53171 287 aa1.28□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B YNR064CP53750 290 aa1.28□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B ELC1Q03071 99 aa1.28□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B YRA1Q12159 226 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B YFR032C-BQ8TGU2 87 aa1.28□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B TDA2P40045 126 aa1.28□□□□□ -2.2
YOR343W-BYOR343W-B SWI1P09547 1314 aa1.28□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B BUB2P26448 306 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YKR070WP36151 352 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YER121WP40076 114 aa1.28□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YPL073CP40323 161 aa1.28□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B COA3Q3E7B2 85 aa1.28□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa1.28□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B KIN28P06242 306 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B HAP3P13434 144 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YGR201CP42936 225 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B PRE1P22141 198 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YGR269WP40326 108 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YDR476CQ03362 224 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B SEN15Q04675 128 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YMR320WQ04897 101 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B UPS1Q05776 175 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B IRC23Q08416 157 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B RAD6P06104 172 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YHR140WP38842 239 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B SRP14P38985 146 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YPR013CQ12145 317 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B PST2Q12335 198 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B KEI1Q06346 221 aa1.27□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B GSP2P32836 220 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B MVB12P42939 101 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YJR015WP47090 510 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B DIE2P50076 525 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B LIP1Q03579 150 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B SDH7Q04401 133 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B TVP18Q04767 167 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B ATG41Q12048 136 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B WIP1Q2V2P8 89 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B SLO1Q3E784 85 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B FPR1P20081 114 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B BEM2P39960 2167 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B GRX8Q05926 109 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B IGO2Q9P305 131 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YHR032W-AP0C5N6 59 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B SRB6P32570 121 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B SPS18P32572 300 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YMR253CQ04835 414 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B CCH1P50077 2039 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B CBF1P17106 351 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B UGX2P32772 223 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B GPI2P46961 280 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B NAT5Q08689 176 aa1.26□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B RRT7Q07829 113 aa1.25□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B SPT14P32363 452 aa1.25□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B AIM18P38884 321 aa1.25□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B TMA23Q03525 211 aa1.25□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B PEX11Q12462 236 aa1.25□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B COX8P04039 78 aa1.25□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B HHT1P61830 136 aa1.25□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B GAL83Q04739 417 aa1.25□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B TAR1Q8TGM6 124 aa1.25□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B ENV10Q99382 181 aa1.25□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B SRX1P36077 127 aa1.25□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B FLO11P08640 1367 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B ANB1P19211 157 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B RPL14AP36105 138 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B ECM31P38122 312 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B RPL14BP38754 138 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B VMA7P39111 118 aa1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.7 ms