RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	FCY2	P17064	533 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YCR025C	P25352	136 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	MRP17	P28778	131 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	IRC22	P40006	225 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YIL077C	P40508	320 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	AIM25	P47140	327 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	HST4	P53688	370 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	CPR8	P53728	308 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	ODC1	Q03028	310 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YLR224W	Q05947	369 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YOR385W	Q08909	290 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YPR063C	Q12160	140 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	MSH5	Q12175	901 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	CRC1	Q12289	327 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	SCM3	Q12334	223 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	TMA17	Q12513	150 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	TOM7	P53507	60 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	USV1	Q12132	391 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	AYT1	Q12226	474 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	SEC22	P22214	214 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	FPR2	P32472	135 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	TIR2	P33890	251 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YKL162C	P36052	402 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	VHS2	P40463	436 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	ATG27	P46989	271 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	AIM24	P47127	394 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YCT1	Q12235	531 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	ERV2	Q12284	196 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	PPQ1	P32945	549 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	SFT2	P38166	215 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	PBA1	Q05778	276 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YPL264C	Q08980	353 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	POM34	Q12445	299 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YPT53	P36019	220 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	MRPL4	P36517	319 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	MBA1	P38300	278 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YHR022C	P38763	256 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	SIT1	P39980	628 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	NIF3	P53081	288 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	PKP2	P53170	491 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	ORM1	P53224	222 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	CCW12	Q12127	133 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	RDI1	Q12434	202 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	MRPL3	P36516	390 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	JLP2	P40206	208 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	SPC1	P46965	94 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	PHO23	P50947	330 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YPS5	P53057	165 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	PDR17	P53844	350 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	SNO1	Q03144	224 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	COA4	Q05809	96 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	ENV7	Q12003	364 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	COA2	Q3E823	68 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YNL057W	YNL057W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	ATP23	P53722	227 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	SHH3	Q04487	196 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	YPL229W	Q99395	206 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	SUA5	P32579	426 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	ELF1	P36053	145 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	PET100	P38958	111 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	SER2	P42941	309 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	MIC27	P50945	234 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	YNR071C	P53757	342 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	TMA23	Q03525	211 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	ARR3	Q06598	404 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	IES3	Q12345	250 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	RTC6	O14464	93 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	Q0255	P03881	472 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	DDI2	P0CH63	225 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	DDI3	P0CH64	225 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	MBB1	P39534	108 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	YJL028W	P47062	111 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL057W	YNL057W	DSK2	P48510	373 aa		3	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 73.6 ms