RNA–Protein interactions for RNA: YML039W

YML039W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YML039W, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML039WYML039W PCL2P25693 308 aa2.23□□□□□ -2.05
YML039WYML039W MIG3P39943 394 aa2.23□□□□□ -2.05
YML039WYML039W PIR5P46999 287 aa2.23□□□□□ -2.05
YML039WYML039W BXI1P48558 297 aa2.23□□□□□ -2.05
YML039WYML039W PNC1P53184 216 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
YML039WYML039W CYC7P00045 113 aa2.23□□□□□ -2.05
YML039WYML039W SRB6P32570 121 aa2.23□□□□□ -2.05
YML039WYML039W GPX2P38143 162 aa2.23□□□□□ -2.05
YML039WYML039W CCS1P40202 249 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
YML039WYML039W CWP2P43497 92 aa2.23□□□□□ -2.05
YML039WYML039W COX12Q01519 83 aa2.23□□□□□ -2.05
YML039WYML039W ECM12O13529 151 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W RPL39P04650 51 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W RAD6P06104 172 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W ATP5P09457 212 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W YBL059WP34224 193 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W AST1P35183 429 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W MPM1P40364 252 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W VHS2P40463 436 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W YIL012WP40551 113 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W RPA43P46669 326 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W YJR096WP47137 282 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W NRG1Q03125 231 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W YMR253CQ04835 414 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W PEX27Q08580 376 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W TAO3P40468 2376 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W PIS1P06197 220 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W ERV1P27882 189 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W PET100P38958 111 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W BNA6P43619 295 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W YJR015WP47090 510 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W YGL149WP53116 101 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W MED7Q08278 222 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W FUN14P18411 198 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W IMP1P28627 190 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W RRT13P40042 185 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W YDR274CP87283 123 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W FKS3Q04952 1785 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W ANT1Q06497 328 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data2.22□□□□□ -2.05not detected
YML039WYML039W YBL112CQ3E7Y4 105 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W VPS63O13549 108 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W SAG1P20840 650 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W SCM4P32564 187 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W POP8P38208 133 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W DER1P38307 211 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W UBC12P52491 188 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W BOR1P53838 576 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W SNO1Q03144 224 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W IZH1Q03419 316 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W TMA23Q03525 211 aa2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
YML039WYML039W HTB2P02294 131 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W MRPL9P31334 269 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W MRPL16P38064 232 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W MRPS9P38120 278 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W ERG28P40030 148 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W HAC1P41546 238 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W MAK3Q03503 176 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W YOR343CQ12484 108 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W YCR006CP25350 157 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W AME1P38313 324 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W GTT1P40582 234 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W TPC1P53257 314 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W YGR219WP53307 113 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W DPP1Q05521 289 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W CTR3Q06686 241 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W TY1B-BRQ12193 1756 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W TY1B-GR3Q12316 1755 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W TY1B-ORQ92393 1755 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W DBP2P24783 546 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W YPT10P38146 199 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W SDH8P38345 138 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W YHR140WP38842 239 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W MST28P39552 234 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W TY1A-MR1Q04215 440 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W TY1A-BLQ12266 440 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W SET6Q12529 373 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W CMC4Q3E7A9 73 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W YLR236CA0A023PZG4 107 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W ADH2P00331 348 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W MRS3P10566 314 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W RMD6P39975 231 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W YER076CP40049 302 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W PRY1P47032 299 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W MIC26P50087 233 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W YDR366CP87287 132 aa2.21□□□□□ -2.06
YML039WYML039W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
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