RNA–Protein interactions for RNA: YKL115C

YKL115C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL115C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL115CYKL115C HUA1P40325 198 aa1.29□□□□□ -2.2
YKL115CYKL115C ETR1P38071 380 aa1.28□□□□□ -2.2
YKL115CYKL115C YBR242WP38331 238 aa1.28□□□□□ -2.2
YKL115CYKL115C RPL37AP49166 88 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
YKL115CYKL115C YNL140CP53910 189 aa1.28□□□□□ -2.2
YKL115CYKL115C RIM9Q04734 239 aa1.28□□□□□ -2.2
YKL115CYKL115C SYM1Q06563 197 aa1.28□□□□□ -2.2
YKL115CYKL115C YEL073CP39974 107 aa1.27□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C PRE1P22141 198 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C CSH1P38287 376 aa1.26□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C PAC10P48363 199 aa1.26□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C MAK3Q03503 176 aa1.26□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C ELP6Q04868 273 aa1.26□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C YDL157CQ12082 118 aa1.26□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C TAR1Q8TGM6 124 aa1.26□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C SRP102P36057 244 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C YGR269WP40326 108 aa1.25□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C LIP1Q03579 150 aa1.25□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C THI74Q04083 370 aa1.25□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C FIT1Q04433 528 aa1.25□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C UIP4Q08926 304 aa1.25□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C YDR476CQ03362 224 aa1.24□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C YPR203WQ08994 102 aa1.24□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C PTC1P35182 281 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C YEL028WP39989 153 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C HSK3P69852 69 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C YLR053CQ12026 108 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C SPS2P08459 502 aa1.22□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C RME1P32338 300 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C YIL102CP40488 101 aa1.22□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C YFL051CP43552 160 aa1.22□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C GEP7P53171 287 aa1.22□□□□□ -2.21
YKL115CYKL115C QCR2P07257 368 aa1.21□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C FES1P38260 290 aa1.21□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C YHL037CP38733 133 aa1.21□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C DCV1P43595 202 aa1.21□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C ATG10Q07879 167 aa1.21□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C LCL2Q08045 131 aa1.21□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C YAR064WP39563 99 aa1.2□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C YGL230CP53074 147 aa1.2□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C YGL101WP53144 215 aa1.2□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C LSM3P57743 89 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C YLR046CQ12253 270 aa1.2□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C RDI1Q12434 202 aa1.2□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C ATP5P09457 212 aa1.19□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C YKR070WP36151 352 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C YER121WP40076 114 aa1.19□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C APS3P47064 194 aa1.19□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C YJR015WP47090 510 aa1.19□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C RPL37BP51402 88 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C YNR064CP53750 290 aa1.19□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C AIM36Q03798 255 aa1.19□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C YPD1Q07688 167 aa1.19□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C TAF2P23255 1407 aa1.18□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C INO4P13902 151 aa1.18□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C SHB17P36136 271 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C DLS1P40366 167 aa1.18□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C CIN5P40917 295 aa1.18□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C KIN28P06242 306 aa1.17□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C ECM31P38122 312 aa1.17□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C YPT31P38555 223 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C VAM10Q08474 114 aa1.17□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C UGX2P32772 223 aa1.16□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C AME1P38313 324 aa1.16□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C HTD2P38790 280 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C YDC1Q02896 317 aa1.16□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C YPR114WQ06107 315 aa1.16□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C KEI1Q06346 221 aa1.16□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C CCW12Q12127 133 aa1.16□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C SLH1P53327 1967 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
YKL115CYKL115C FMP49A0A023PZB3 126 aa1.15□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C YER188C-AP0C0V2 99 aa1.15□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C RPL30P14120 105 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C APQ12P40532 138 aa1.15□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C TLG1Q03322 224 aa1.15□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C YDR102CQ03864 110 aa1.15□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C AVO2Q04749 426 aa1.15□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C FCY1Q12178 158 aa1.15□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C YGL041W-AP0C5N3 154 aa1.14□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C BUB2P26448 306 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C SPT14P32363 452 aa1.14□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C CCC1P47818 322 aa1.14□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C ATP19P81451 68 aa1.14□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C PEX34P25584 144 aa1.13□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C GLC8P41818 229 aa1.13□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C YGL193CP53097 103 aa1.13□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C ORM1P53224 222 aa1.13□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C NMA1Q06178 401 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C YEL014CP39999 101 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C YDL241WQ07738 123 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL115CYKL115C NSL1Q12143 216 aa1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.4 ms