RNA–Protein interactions for RNA: YKL003C

MRP17, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP17, Length 396 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP17	YKL003C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	RRG8	Q06109	277 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	CDC7	P06243	507 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	FPR2	P32472	135 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	SLM6	P38343	150 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	YGR269W	P40326	108 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	YJR015W	P47090	510 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	RRF1	P38771	230 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	SNF11	P38956	169 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	GNP1	P48813	663 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	COX12	Q01519	83 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	YMR082C	Q04276	118 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	ARR3	Q06598	404 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	LDS2	Q08218	356 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	PRM7	Q12459	698 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	GPI2	P46961	280 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	ATG27	P46989	271 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	PKP2	P53170	491 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	HST4	P53688	370 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	AYT1	Q12226	474 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	PRR2	Q12310	699 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRP17	YKL003C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	CMC1	P36064	111 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	SWM2	P40342	146 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	TIM44	Q01852	431 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	UPS2	P35200	230 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	AIM24	P47127	394 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YIP3	P53633	176 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	BOR1	P53838	576 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	SHH3	Q04487	196 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	ISN1	Q99312	450 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
MRP17	YKL003C	SFT2	P38166	215 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YER135C	P40082	130 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	MIC27	P50945	234 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	ODC1	Q03028	310 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	SDH7	Q04401	133 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	CTR3	Q06686	241 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	IZH3	Q07959	543 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YBL059W	P34224	193 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	PET100	P38958	111 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	MIG3	P39943	394 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YIL077C	P40508	320 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	DID2	P69771	204 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	UBC7	Q02159	165 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	GCN3	P14741	305 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	ACB1	P31787	87 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	TIR2	P33890	251 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YEA4	P40004	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YFR035C	P43608	114 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YGL117W	P53133	265 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	ORM1	P53224	222 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	IZH1	Q03419	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	CDC50	P25656	391 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	AVO2	Q04749	426 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	STP4	Q07351	490 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
MRP17	YKL003C	SCM3	Q12334	223 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	DDI2	P0CH63	225 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	DDI3	P0CH64	225 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	AHT1	P29589	182 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	NPL6	P32832	435 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	DER1	P38307	211 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	VMA22	P38784	181 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	SAS2	P40963	338 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	TAD2	P47058	250 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YNR071C	P53757	342 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP17	YKL003C	ZRC1	P20107	442 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP17	YKL003C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRP17	YKL003C	SPO13	P23624	291 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP17	YKL003C	YCR001W	P25347	104 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP17	YKL003C	PHD1	P36093	366 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP17	YKL003C	MBB1	P39534	108 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP17	YKL003C	HUA1	P40325	198 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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