RNA–Protein interactions for RNA: YJL089W

SIP4, Transcript of C6 zinc cluster transcriptional activator, yeast

Gene SIP4, Length 2,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP4	YJL089W	AVT5	P38176	459 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	VMA22	P38784	181 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	GPI2	P46961	280 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	SNX4	P47057	423 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	UBC11	P52492	156 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	LST7	P53237	242 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YIP3	P53633	176 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	HST4	P53688	370 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YNR071C	P53757	342 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	PDR17	P53844	350 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	OCA2	P53949	197 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	UBC7	Q02159	165 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	DYN2	Q02647	92 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	VPS28	Q02767	242 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	NRG1	Q03125	231 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	ORM2	Q06144	216 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	VAM10	Q08474	114 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	SCM3	Q12334	223 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	IES3	Q12345	250 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	ATG5	Q12380	294 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	RPN13	O13563	156 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	DDI2	P0CH63	225 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	DDI3	P0CH64	225 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	MRS3	P10566	314 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	FCY2	P17064	533 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	SEC22	P22214	214 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	QCR9	P22289	66 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	SIP1	P32578	815 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	IMP2	P46972	177 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YJR096W	P47137	282 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	MCM22	P47167	239 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	MIC26	P50087	233 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	MIC27	P50945	234 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	PKP2	P53170	491 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	CAX4	P53223	239 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	CAF40	P53829	373 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	SGF11	Q03067	99 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	MRPS8	Q03799	155 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	ATX2	Q12067	313 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	CCW12	Q12127	133 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YLR415C	O13578	112 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	CDC7	P06243	507 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	SFT2	P38166	215 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	RRF1	P38771	230 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YEA6	P39953	335 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YEA4	P40004	342 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YKE4	P40544	346 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YIR035C	P40579	254 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	COX16	P47081	118 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	AIM24	P47127	394 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	SRB7	P47822	140 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	MRX11	Q03079	207 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	SNO1	Q03144	224 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YMR181C	Q03231	154 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	IZH1	Q03419	316 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YMR244W	Q04018	355 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YMR082C	Q04276	118 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	SHH3	Q04487	196 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	IRC23	Q08416	157 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YPR013C	Q12145	317 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	AYT1	Q12226	474 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	CPT1	P17898	393 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	MRS4	P23500	304 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	VMA16	P23968	213 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YCR025C	P25352	136 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	ECM25	P32525	599 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YBR292C	P38357	123 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	PET100	P38958	111 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	SPI1	P40092	148 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YGR269W	P40326	108 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	SIM1	P40472	476 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YCH1	P42937	148 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YJR015W	P47090	510 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	TIM21	P53220	239 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	YNR066C	P53752	436 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	DID2	P69771	204 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SIP4	YJL089W	HAL1	Q01766	294 aa		0.86	□□□□□ -2.27

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