RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	OST3	P48439	350 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MGA1	P53050	456 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MST27	P53176	234 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DSL1	P53847	754 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YMR320W	Q04897	101 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YDR286C	Q05530	114 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RNH202	Q05635	350 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YOL131W	Q08270	108 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YOR292C	Q08743	309 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	AEP3	Q12089	606 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	EAF3	Q12432	401 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	COX9	P07255	59 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PET122	P10355	254 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ACP1	P32463	125 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SUA5	P32579	426 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	UGX2	P32772	223 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DER1	P38307	211 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YAR029W	P39549	74 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DLS1	P40366	167 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YGL204C	P53089	101 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	TIM21	P53220	239 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	EOS1	P53938	366 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	UBC7	Q02159	165 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PEX30	Q06169	523 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RRT15	Q3E811	62 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	STF1	P01098	86 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ATR1	P13090	542 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	STE18	P18852	110 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RNP1	P32385	249 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PPQ1	P32945	549 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MRPL28	P36527	147 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YBL071C	P38185	102 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	BDH1	P39714	382 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	GLE2	P40066	365 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PEP8	P40335	379 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PGD1	P40356	397 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	BNA6	P43619	295 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	USE1	P53146	245 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YGR016W	P53209	190 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YNL019C	P53975	284 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SHR3	Q02774	210 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SML1	Q04964	104 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.16	□□□□□ -2.38	not detected
AI1	Q0050	APL4	Q12028	832 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ATG41	Q12048	136 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RDI1	Q12434	202 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YML054C-A	Q3E809	52 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YOS1	Q3E834	85 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	QCR7	P00128	127 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DDI2	P0CH63	225 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DDI3	P0CH64	225 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	HAP3	P13434	144 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	CBF1	P17106	351 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	FAR1	P21268	830 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	CPR4	P25334	318 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	CSM1	P25651	190 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YHL005C	P38752	130 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YHR022C	P38763	256 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	TEM1	P38987	245 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PEX22	P39718	180 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YER134C	P40081	178 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	HUA1	P40325	198 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DFG10	P40526	253 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	INA22	P40576	216 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	OTU1	P43558	301 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	LCB3	P47013	409 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	KNH1	P50112	268 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	POP6	P53218	158 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	VHT1	P53241	593 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SNA2	P56508	79 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PMP3	P87284	55 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	TMA23	Q03525	211 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	AVO2	Q04749	426 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	APC9	Q12107	265 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YLR125W	Q12138	136 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	NSL1	Q12143	216 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SNF8	Q12483	233 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
AI1	Q0050	SNF4	P12904	322 aa		0.15	□□□□□ -2.39

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