RNA–Protein interactions for RNA: YKR059W

TIF1, Transcript of Translation initiation factor eIF4A, yeast

Gene TIF1, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIF1	YKR059W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	YBR063C	P38083	404 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	MIG3	P39943	394 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	FLX1	P40464	311 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	POG1	P40473	351 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	IGD1	P43598	195 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	NNT1	Q05874	261 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	RPL39	P04650	51 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	TFC1	P32367	649 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	POP8	P38208	133 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	FIG1	P38224	298 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	SRP14	P38985	146 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	UFD1	P53044	361 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	NUP49	Q02199	472 aa		5	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	COX5B	P00425	151 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	PHO80	P20052	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	CTR2	P38865	189 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	SPO73	P40031	143 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	PDR17	P53844	350 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	AAH1	P53909	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	YML108W	Q03759	105 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	GPI17	Q04080	534 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	TRM10	Q12400	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	YJR056C	P47115	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	ILM1	P47155	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	BXI1	P48558	297 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	ELP6	Q04868	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	SPC2	Q04969	178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	QCR2	P07257	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	MRPS28	P21771	286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	ERG2	P32352	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	XPT1	P47165	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	MRH4	P53166	561 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	ARR2	Q06597	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	RFU1	Q08003	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIF1	YKR059W	GCN3	P14741	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	SPS18	P32572	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	AVT6	P40074	448 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	OST3	P48439	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	PRM8	P53174	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	LOA1	Q06508	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	RMD6	P39975	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	FAR7	P43592	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	YGL118C	P53132	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	YIP3	P53633	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	APJ1	P53940	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	SPC24	Q04477	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	YNG1	Q08465	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	YCR025C	P25352	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	MRX8	Q05473	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	RIB3	Q99258	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	PCL1	P24867	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	IPT1	P38954	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	CCC1	P47818	322 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	YGL262W	P53054	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	PGA1	P53896	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	PUT1	P09368	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	MRPL28	P36527	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	GON7	P46984	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	YGR018C	P53211	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	ZRT3	P34240	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	ECM31	P38122	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	AME1	P38313	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	RRG9	P40156	214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	AGE2	P40529	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	NRK1	P53915	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	COG5	P53951	403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	SNO1	Q03144	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	VPS71	Q03433	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	GAL83	Q04739	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIF1	YKR059W	SGA1	P08019	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	APS1	P35181	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	KRE9	P39005	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	BOR1	P53838	576 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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