RNA–Protein interactions for RNA: YKR041W

YKR041W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR041W, Length 753 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR041W	YKR041W	PCP1	P53259	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YNR064C	P53750	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	CWC27	Q02770	301 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	TRS23	Q03784	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	TSA2	Q04120	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	UPS1	Q05776	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	CNL1	Q06333	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	ARR2	Q06597	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YPS3	Q12303	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	MRS4	P23500	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	ELO2	P25358	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	HMX1	P32339	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	SPS18	P32572	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	MIX23	P38162	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	PIG2	P40187	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	PGU1	P47180	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	GEP7	P53171	287 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	RPN14	P53196	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YGR050C	P53231	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	SUN4	P53616	420 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	MRPL19	P53875	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	RCE1	Q03530	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	TVP18	Q04767	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	MCH1	Q07376	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YFH1	Q07540	174 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	FRE7	Q12333	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	FCY2	P17064	533 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	SAG1	P20840	650 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YGL010W	P25338	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YCR007C	P25354	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YBL059W	P34224	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	QDR3	P38227	689 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	AME1	P38313	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	PSD1	P39006	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YGR269W	P40326	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	STP4	Q07351	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	COX1	P00401	534 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	MSI1	P13712	422 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YKL187C	P34231	750 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	PAU16	P35994	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	MCH2	P36032	473 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	SWD3	P38123	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	DOG1	P38774	246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	ATF1	P40353	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	RPA43	P46669	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	XPT1	P47165	209 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	BOR1	P53838	576 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	SDC1	Q03323	175 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	RIM9	Q04734	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	TRI1	Q05024	226 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	NAT3	Q06504	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	LOA1	Q06508	300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	PAU23	Q07987	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	PAU17	Q12370	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR041W	YKR041W	VPS63	O13549	108 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	ERG8	P24521	451 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	PMU1	P36069	295 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	DAD2	P36162	133 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	ICS2	P38284	255 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	PCL7	P40186	285 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	YIL169C	P40442	995 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	SAS2	P40963	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	YIP5	P53108	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	AKR2	Q12013	749 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	CYC7	P00045	113 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	YMR31	P19955	123 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	YCR006C	P25350	157 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR041W	YKR041W	SRP21	P32342	167 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.4 ms