RNA–Protein interactions for RNA: YJR055W

HIT1, Transcript of Protein involved in C/D snoRNP assembly, yeast

Gene HIT1, Length 495 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HIT1	YJR055W	UBR1	P19812	1950 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	REP2	P03872	296 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	GPA2	P10823	449 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YGL010W	P25338	174 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	TFC1	P32367	649 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	SRY1	P36007	326 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	MRPL17	P36528	281 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	MSS2	P40990	351 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	OTU1	P43558	301 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YNR077C	P53758	84 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	PDR17	P53844	350 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	PIR1	Q03178	341 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	RNH1	Q04740	348 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	NCB2	Q92317	146 aa		0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	NTG1	P31378	399 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	KDX1	P36005	433 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	ECM4	P36156	370 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	MRPL15	P36523	253 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	AIM2	P39721	246 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YIL086C	P40503	102 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YRB2	P40517	327 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	BOL2	P53082	120 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	PGA2	P53903	129 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	NUP49	Q02199	472 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	FUS2	Q05670	677 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YOL160W	Q08321	113 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YLR046C	Q12253	270 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YDL180W	Q12301	547 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	GIS3	Q12418	502 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		0.75	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	MER1	P16523	270 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	CBF1	P17106	351 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	SPS18	P32572	300 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YBR285W	P38354	144 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	AIM25	P47140	327 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	CGR1	P53188	120 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	ANT1	Q06497	328 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	HTB2	P02294	131 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YBR220C	P38318	560 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YER135C	P40082	130 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	MGA1	P53050	456 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	DOC1	P53068	250 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YLR162W	Q06235	118 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	GGA1	Q06336	557 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	RAD28	Q12021	506 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	MCP1	Q12106	302 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	SIR2	P06700	562 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	SIP3	P38717	1229 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	IKI1	P38874	309 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	CUP9	P41817	306 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	GET1	P53192	235 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	ARG80	P07249	177 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	YCR087C-A	P37263	153 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	KNH1	P50112	268 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	YGR050C	P53231	118 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	COG5	P53951	403 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	VPS71	Q03433	280 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	YDR249C	Q03787	373 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	PEX11	Q12462	236 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	ATG40	Q99325	256 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HIT1	YJR055W	SEC17	P32602	292 aa		0.7	□□□□□ -2.3

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