RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A YOL024WQ08172 172 aa0.68□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A TAR1Q8TGM6 124 aa0.68□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A AHT1P29589 182 aa0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A YBL010CP32788 280 aa0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A NSA2P40078 261 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A GPI14P47088 403 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A SBH2P52871 88 aa0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A PGA1P53896 198 aa0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A NRK1P53915 240 aa0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A GRX5Q02784 150 aa0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A PIR1Q03178 341 aa0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A CWC21Q03375 135 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A FYV12Q08559 129 aa0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A DAS2Q12084 232 aa0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A YOR342CQ12182 319 aa0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A PST2Q12335 198 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A DGK1Q12382 290 aa0.67□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A ADE1P27616 306 aa0.66□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A MPM1P40364 252 aa0.66□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A NSE4P43124 402 aa0.66□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A YGL235WP53071 178 aa0.66□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A YMR030W-AQ3E760 96 aa0.66□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A SLH1P53327 1967 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A ETR1P38071 380 aa0.65□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A YHL037CP38733 133 aa0.65□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A YIL102CP40488 101 aa0.65□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A DML1Q03652 475 aa0.65□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A UPS1Q05776 175 aa0.65□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A ATP20Q12233 115 aa0.65□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A MAK31P23059 88 aa0.64□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A TAH1P25638 111 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A CAF4P36130 643 aa0.64□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A RRT1P38192 103 aa0.64□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A YFL051CP43552 160 aa0.64□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A AIM34Q03673 198 aa0.64□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A YHP1Q04116 353 aa0.64□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A FIT1Q04433 528 aa0.64□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A CCW12Q12127 133 aa0.64□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A FMP49A0A023PZB3 126 aa0.63□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A YAR064WP39563 99 aa0.63□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A FMP32P43557 207 aa0.63□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A DCV1P43595 202 aa0.63□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A SBH1P52870 82 aa0.63□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A MPD1Q12404 318 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A TRX3P25372 127 aa0.62□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A SHG1P38337 142 aa0.62□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A CCS1P40202 249 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A HHT1P61830 136 aa0.62□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A GAL83Q04739 417 aa0.62□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A ELP6Q04868 273 aa0.62□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A ATG41Q12048 136 aa0.62□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A AHC2P25649 128 aa0.61□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data0.61□□□□□ -2.31not detected
RPC10YHR143W-A YJR015WP47090 510 aa0.61□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A VPS28Q02767 242 aa0.61□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A SHH4Q06236 168 aa0.61□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A YOR381W-AQ3E804 55 aa0.61□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A RAD9P14737 1309 aa0.61□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A HSP30P25619 332 aa0.6□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A GRX8Q05926 109 aa0.6□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data0.59□□□□□ -2.31not detected
RPC10YHR143W-A YKL102CP34249 101 aa0.59□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A YKR070WP36151 352 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A RFC2P40348 353 aa0.59□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A GPI17Q04080 534 aa0.59□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A HPT1Q04178 221 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A YPR127WQ06494 345 aa0.59□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A YET3Q07451 203 aa0.59□□□□□ -2.31
RPC10YHR143W-A FYV4P38783 130 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A NVJ1P38881 321 aa0.58□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A YGL230CP53074 147 aa0.58□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A YKR005CQ02203 525 aa0.58□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A RIM9Q04734 239 aa0.58□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A PRE1P22141 198 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A SEC14P24280 304 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A SHB17P36136 271 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A YNL200CP40165 246 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A MOB1P40484 314 aa0.57□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A PAC10P48363 199 aa0.57□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A HOP2P53187 214 aa0.57□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A TMA23Q03525 211 aa0.57□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A BRX1Q08235 291 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A YOR214CQ12282 236 aa0.57□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A FAS1P07149 2051 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A XPT1P47165 209 aa0.56□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A TTI2P47168 421 aa0.56□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A NQM1P53228 333 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A TIM13P53299 105 aa0.56□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A YDC1Q02896 317 aa0.56□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A SNO1Q03144 224 aa0.56□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A KEI1Q06346 221 aa0.56□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A RAD6P06104 172 aa0.55□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A NUF2P33895 451 aa0.55□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A CLG1P35190 452 aa0.55□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A YKR041WP36134 250 aa0.55□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A GLR1P41921 483 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RPC10YHR143W-A JAC1P53193 184 aa0.55□□□□□ -2.32
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