RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C ERV2Q12284 196 aa2.74□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C DFM1Q12743 341 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C ADH1P00330 348 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C RPA12P32529 125 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YHL026CP38740 315 aa2.74□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C CUP9P41817 306 aa2.74□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C PAU12P53343 120 aa2.74□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C BSP1Q06604 576 aa2.74□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C DGA1Q08650 418 aa2.74□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YPQ1Q12010 308 aa2.74□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C BSC1Q12140 328 aa2.74□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C COX9P07255 59 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YMR31P19955 123 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C ATS1P31386 333 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C MKK1P32490 508 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C RPB7P34087 171 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YKR070WP36151 352 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C ATX1P38636 73 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YHR210CP38893 341 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YFR045WP43617 309 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YNL143CP53908 130 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C INM2Q05533 292 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C CRD1Q07560 283 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YOR376WQ08900 122 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C MRS1P07266 363 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C CHO1P08456 276 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C PHO85P17157 305 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C REG2P38232 338 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C GLE2P40066 365 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C BTT1P40314 149 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C COQ5P49017 307 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YNR064CP53750 290 aa2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C RHO5P53879 331 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C VMA11P32842 164 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.72□□□□□ -1.97not detected
DOA4YDR069C TIR2P33890 251 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C SHB17P36136 271 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C BAT1P38891 393 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C PAM16P42949 149 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C UBP8P50102 471 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C ERG25P53045 309 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YNR048WP53740 393 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C BET5Q03630 159 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C HLR1Q04429 423 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C PEX11Q12462 236 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YKL183C-AQ3E765 70 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YOS1Q3E834 85 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C UBA3Q99344 299 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C RPL28P02406 149 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C HEM2P05373 342 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C CPA1P07258 411 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C ERV1P27882 189 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C SRP21P32342 167 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C PAU2P32612 120 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C SHE1P38200 338 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YIL059CP40520 121 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C BRR6P53062 197 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C GRX8Q05926 109 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C TIM9O74700 87 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C RFA3P26755 122 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YEA4P40004 342 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YFL012WP43580 148 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C CAB4P53332 305 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C SCW4P53334 386 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C IRC15Q02733 499 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C ADD37Q03233 198 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C EMI1Q04406 187 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YOL024WQ08172 172 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YJR112W-AQ3E743 109 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YBR126W-AQ8TGU7 68 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C ATG40Q99325 256 aa2.72□□□□□ -1.97
DOA4YDR069C YDR157WA0A023PZE8 133 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C ILV1P00927 576 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C YAR066WP0CX18 203 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C YHR214WP0CX19 203 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C RPL12BP0CX54 165 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C HMRA1P0CY11 126 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C SEC11P15367 167 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C BET2P20133 325 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C PTH1P38876 190 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C AXL2P38928 823 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C TRM112P53738 135 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C ALG9P53868 555 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C SDC1Q03323 175 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C NUP53Q03790 475 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C LDS2Q08218 356 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C PMD1P32634 1753 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C YSC83P32792 385 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C ASK1P35734 292 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C PAU24P38155 120 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C YJL193WP39542 402 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C OST2P46964 130 aa2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C RRT6P53117 311 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
DOA4YDR069C MMS2P53152 137 aa2.71□□□□□ -1.98
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