RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnf103Q9R1W3 683 aa23.33■■□□□ 1.33
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chmp6P0C0A3 200 aa23.32■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lsp1P19973 330 aa23.32■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hoxd8P23463 289 aa23.32■■□□□ 1.32
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Shkbp1Q6P7W2 704 aa23.32■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trim65Q8BFW4 522 aa23.32■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Art3Q8R2G4 371 aa23.32■■□□□ 1.32
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ephx1Q9D379 455 aa23.32■■□□□ 1.32
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wnt6P22727 364 aa23.31■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col9a1Q05722 921 aa23.31■■□□□ 1.32
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cse1lQ9ERK4 971 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm5580A0A0N4SVP8 411 aa23.3■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wfdc11A2A5H7 82 aa23.3■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm4846B2RWH8 538 aa23.3■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn2r19G5E8G4 854 aa23.3■■□□□ 1.32
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm281D3Z1Y0 860 aa23.29■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rdh7O88451 316 aa23.29■■□□□ 1.32
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Senp1P59110 640 aa23.29■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Anks1aP59672 1150 aa23.29■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmprss15P97435 1069 aa23.29■■□□□ 1.32
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q3TTJ4 293 aa23.29■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cachd1Q6PDJ1 1288 aa23.29■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmc8Q7TN58 722 aa23.29■■□□□ 1.32
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdr35Q8BND3 1181 aa23.29■■□□□ 1.32
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gas2l1Q8JZP9 678 aa23.29■■□□□ 1.32
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc14Q8K2J4 934 aa23.29■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa23.29■■□□□ 1.32
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc26a1P58735 704 aa23.28■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CtcfQ61164 736 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccpg1Q640L3 753 aa23.28■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr412Q7TRW7 312 aa23.28■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cct8l1Q80YT3 562 aa23.28■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lig4Q8BTF7 911 aa23.28■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pyhin1Q8BV49 420 aa23.28■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Calhm5Q8R100 309 aa23.28■■□□□ 1.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1700123K08RikQ9D991 295 aa23.28■■□□□ 1.32
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa23.28■■□□□ 1.32
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