Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Cse1lQ9ERK4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cse1lQ9ERK4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cse1lQ9ERK4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cse1lQ9ERK4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cse1lQ9ERK4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cse1lQ9ERK4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Cse1lQ9ERK4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Cse1lQ9ERK4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cse1lQ9ERK4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Cse1lQ9ERK4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cse1lQ9ERK4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cse1lQ9ERK4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Cse1lQ9ERK4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Cse1lQ9ERK4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cse1lQ9ERK4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cse1lQ9ERK4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cse1lQ9ERK4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cse1lQ9ERK4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cse1lQ9ERK4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cse1lQ9ERK4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cse1lQ9ERK4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cse1lQ9ERK4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cse1lQ9ERK4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cse1lQ9ERK4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cse1lQ9ERK4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cse1lQ9ERK4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Cse1lQ9ERK4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Cse1lQ9ERK4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cse1lQ9ERK4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cse1lQ9ERK4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cse1lQ9ERK4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cse1lQ9ERK4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cse1lQ9ERK4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cse1lQ9ERK4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cse1lQ9ERK4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cse1lQ9ERK4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cse1lQ9ERK4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cse1lQ9ERK4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Cse1lQ9ERK4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cse1lQ9ERK4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cse1lQ9ERK4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Cse1lQ9ERK4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cse1lQ9ERK4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cse1lQ9ERK4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Cse1lQ9ERK4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cse1lQ9ERK4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Cse1lQ9ERK4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cse1lQ9ERK4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cse1lQ9ERK4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Cse1lQ9ERK4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cse1lQ9ERK4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cse1lQ9ERK4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cse1lQ9ERK4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cse1lQ9ERK4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Cse1lQ9ERK4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Cse1lQ9ERK4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cse1lQ9ERK4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cse1lQ9ERK4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Cse1lQ9ERK4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cse1lQ9ERK4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cse1lQ9ERK4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cse1lQ9ERK4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cse1lQ9ERK4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cse1lQ9ERK4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cse1lQ9ERK4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cse1lQ9ERK4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cse1lQ9ERK4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cse1lQ9ERK4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cse1lQ9ERK4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Cse1lQ9ERK4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Cse1lQ9ERK4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cse1lQ9ERK4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cse1lQ9ERK4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cse1lQ9ERK4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cse1lQ9ERK4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cse1lQ9ERK4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cse1lQ9ERK4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cse1lQ9ERK4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cse1lQ9ERK4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cse1lQ9ERK4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cse1lQ9ERK4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cse1lQ9ERK4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cse1lQ9ERK4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cse1lQ9ERK4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cse1lQ9ERK4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cse1lQ9ERK4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cse1lQ9ERK4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cse1lQ9ERK4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cse1lQ9ERK4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cse1lQ9ERK4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cse1lQ9ERK4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cse1lQ9ERK4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cse1lQ9ERK4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cse1lQ9ERK4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cse1lQ9ERK4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cse1lQ9ERK4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cse1lQ9ERK4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cse1lQ9ERK4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cse1lQ9ERK4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
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