Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
Hoxd8P23463 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Hoxd8P23463 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Hoxd8P23463 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Hoxd8P23463 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Hoxd8P23463 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Hoxd8P23463 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Hoxd8P23463 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Hoxd8P23463 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Hoxd8P23463 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Hoxd8P23463 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Hoxd8P23463 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Hoxd8P23463 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Hoxd8P23463 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Hoxd8P23463 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Hoxd8P23463 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Hoxd8P23463 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hoxd8P23463 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hoxd8P23463 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Hoxd8P23463 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Hoxd8P23463 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Hoxd8P23463 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Hoxd8P23463 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hoxd8P23463 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hoxd8P23463 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Hoxd8P23463 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hoxd8P23463 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Hoxd8P23463 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Hoxd8P23463 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Hoxd8P23463 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Hoxd8P23463 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Hoxd8P23463 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Hoxd8P23463 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Hoxd8P23463 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hoxd8P23463 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hoxd8P23463 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Hoxd8P23463 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Hoxd8P23463 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Hoxd8P23463 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Hoxd8P23463 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Hoxd8P23463 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hoxd8P23463 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Hoxd8P23463 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Hoxd8P23463 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Hoxd8P23463 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Hoxd8P23463 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Hoxd8P23463 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Hoxd8P23463 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Hoxd8P23463 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Hoxd8P23463 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Hoxd8P23463 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Hoxd8P23463 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Hoxd8P23463 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Hoxd8P23463 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Hoxd8P23463 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Hoxd8P23463 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Hoxd8P23463 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hoxd8P23463 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Hoxd8P23463 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Hoxd8P23463 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hoxd8P23463 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hoxd8P23463 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Hoxd8P23463 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Hoxd8P23463 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Hoxd8P23463 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Hoxd8P23463 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Hoxd8P23463 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Hoxd8P23463 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Hoxd8P23463 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hoxd8P23463 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Hoxd8P23463 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hoxd8P23463 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hoxd8P23463 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hoxd8P23463 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Hoxd8P23463 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Hoxd8P23463 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hoxd8P23463 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hoxd8P23463 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hoxd8P23463 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hoxd8P23463 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hoxd8P23463 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Hoxd8P23463 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Hoxd8P23463 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Hoxd8P23463 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Hoxd8P23463 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Hoxd8P23463 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hoxd8P23463 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Hoxd8P23463 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hoxd8P23463 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hoxd8P23463 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hoxd8P23463 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Hoxd8P23463 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hoxd8P23463 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hoxd8P23463 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hoxd8P23463 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hoxd8P23463 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hoxd8P23463 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxd8P23463 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxd8P23463 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hoxd8P23463 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms