RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	MED4	Q12343	284 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	TRM10	Q12400	293 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	VPS63	O13549	108 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	HIS3	P06633	220 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	OTU1	P43558	301 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	VHT1	P53241	593 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	FMP42	Q04991	504 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	HRD1	Q08109	551 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	RBD2	Q12270	262 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	SAL1	D6W196	494 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	QCR7	P00128	127 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	CYC3	P06182	269 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	PHD1	P36093	366 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	RPR2	P40571	144 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	IRC18	P47056	224 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	MCM21	Q06675	368 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	UBA3	Q99344	299 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	MET17	P06106	444 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	CHO1	P08456	276 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	FMP23	P38231	175 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	DOG2	P38773	246 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	DOG1	P38774	246 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	RTT105	P40063	208 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	MSS2	P40990	351 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	OCA2	P53949	197 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	MEH1	Q02205	184 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YML018C	Q03730	393 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	GPN3	Q06543	272 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YPR195C	Q06594	109 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	RXT3	Q07458	294 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YNG1	Q08465	219 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YOR352W	Q08816	343 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	MED11	Q99278	115 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	RNP1	P32385	249 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	RIB7	P33312	244 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	UPS2	P35200	230 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	CDS1	P38221	457 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	POP2	P39008	433 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	AIM20	P40451	204 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	POR2	P40478	281 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	DFG10	P40526	253 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	MDJ2	P42834	146 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	BNA6	P43619	295 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	YMR130W	Q04223	302 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	VBA1	Q04301	562 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	STP4	Q07351	490 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	TIM18	Q08749	192 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	RAD28	Q12021	506 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	ATG41	Q12048	136 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	CAP2	P13517	287 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	YCR001W	P25347	104 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	RRT1	P38192	103 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	SGF11	Q03067	99 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	RTT103	Q05543	409 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	YLR031W	Q07978	186 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	FEX1	Q08913	375 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	FEX2	Q08991	375 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	ATG31	Q12421	196 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	PRM4	Q12498	284 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	VMA22	P38784	181 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	SNF11	P38956	169 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	ILM1	P47155	203 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	GNP1	P48813	663 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	DYN2	Q02647	92 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	TAF3	Q12297	353 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	PRM7	Q12459	698 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	AFR1	P33304	620 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	COS8	P38723	381 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	YGR025W	P53216	100 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	NRG1	Q03125	231 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	YMR244W	Q04018	355 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	POS5	Q06892	414 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	ATG5	Q12380	294 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	FMT1	P32785	401 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	CMC1	P36064	111 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	YBL071C	P38185	102 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	PCL6	P40038	420 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	CAT5	P41735	233 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	YIP3	P53633	176 aa		3.17	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53 ms