RNA–Protein interactions for RNA: YKL208W

CBT1, Transcript of Protein involved in 5' RNA end processing, yeast

Gene CBT1, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBT1	YKL208W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	APJ1	P53940	528 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	FEX1	Q08913	375 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	FEX2	Q08991	375 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	TSC3	Q3E790	80 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	PDR11	P40550	1411 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	AHC2	P25649	128 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	FMT1	P32785	401 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	FIG1	P38224	298 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	NVJ1	P38881	321 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	DSK2	P48510	373 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	AIM34	Q03673	198 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	ARO7	P32178	256 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	SCM4	P32564	187 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YKR041W	P36134	250 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YHL026C	P38740	315 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YKE4	P40544	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	SWP1	Q02795	286 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	MCP1	Q12106	302 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	PEX11	Q12462	236 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	USO1	P25386	1790 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	MSW1	P04803	379 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	MRPS28	P21771	286 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YER076C	P40049	302 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
CBT1	YKL208W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	SHH4	Q06236	168 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CBT1	YKL208W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	MAK3	Q03503	176 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	NSL1	Q12143	216 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	IML1	P47170	1584 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	AGA2	P32781	87 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	TVP38	P36164	337 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	YGL088W	P53151	121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	PGA1	P53896	198 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	YPR195C	Q06594	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	YAP3	P38749	330 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	DGA1	Q08650	418 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	MHT1	Q12525	324 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	GCN2	P15442	1659 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	ICE2	P40499	491 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	TDA4	P47153	279 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	AIF1	P52923	378 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	COS6	P53344	381 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	GPI17	Q04080	534 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	TRM12	Q04235	462 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	DYN3	Q04949	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	RDI1	Q12434	202 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	KRE1	P17260	313 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	SCO1	P23833	295 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	SNC2	P33328	115 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	DER1	P38307	211 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	MNN5	P46982	586 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	PIR5	P46999	287 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	ARR2	Q06597	130 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	NUP192	P47054	1683 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	TIM9	O74700	87 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	OCH1	P31755	480 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	MRPL17	P36528	281 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	FMP23	P38231	175 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	CTR2	P38865	189 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	AVT2	P39981	480 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	PGD1	P40356	397 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	SNX4	P47057	423 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CBT1	YKL208W	CCH1	P50077	2039 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CBT1	YKL208W	YPR096C	O13587	100 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CBT1	YKL208W	MEI4	P29467	408 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CBT1	YKL208W	YKL102C	P34249	101 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CBT1	YKL208W	UMP1	P38293	148 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CBT1	YKL208W	YER084W	P40057	128 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CBT1	YKL208W	YER134C	P40081	178 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CBT1	YKL208W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.7 ms