RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	PAU8	P0CE92	120 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	PAU11	P0CE93	120 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	YMR31	P19955	123 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	QCR9	P22289	66 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	CPR5	P35176	225 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	PAU13	P38725	120 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	PHS1	P40857	217 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	DAN1	P47178	298 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	ALG12	P53730	551 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	CRZ1	P53968	678 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	PAU10	Q03050	120 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	PAU20	Q08322	120 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	PAU9	Q3E770	120 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	VPS63	O13549	108 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	CDC7	P06243	507 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	FCY2	P17064	533 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	POP5	P28005	173 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	ACP1	P32463	125 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	SDH4	P37298	181 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	MRPS9	P38120	278 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	YBR220C	P38318	560 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	TRS20	P38334	175 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	COX15	P40086	486 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	PAU15	P40585	124 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	YGL260W	P53056	76 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	APA2	P22108	325 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	CUE1	P38428	203 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	WSS1	P38838	269 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	MGA1	P53050	456 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	HCH1	P53834	153 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	ECM18	Q04623	453 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	YGR269W	P40326	108 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	YFL051C	P43552	160 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	BNS1	P50084	137 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	DMA2	P53924	522 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	SUR7	P54003	302 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	YHL037C	P38733	133 aa		6.91	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	GAT3	Q07928	141 aa		6.91	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	YLR118C	Q12354	227 aa		6.91	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	POF1	P25576	258 aa		6.9	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	SDH8	P38345	138 aa		6.9	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	YAP1802	P53309	568 aa		6.9	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	API2	Q04413	109 aa		6.9	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	DAL4	Q04895	635 aa		6.9	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		6.9	□□□□□ -1.3
GGA2	YHR108W	RPL39	P04650	51 aa		6.9	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	PSD1	P39006	500 aa		6.9	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	BNA2	P47125	453 aa		6.9	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	CTR3	Q06686	241 aa		6.9	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	YPS3	Q12303	508 aa		6.9	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	YOS1	Q3E834	85 aa		6.9	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	6.89	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	DAL3	P32459	195 aa		6.89	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	YBL059W	P34224	193 aa		6.89	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	PIR5	P46999	287 aa		6.89	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	ARR3	Q06598	404 aa		6.89	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	USV1	Q12132	391 aa		6.89	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	6.89	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	6.88	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	QDR3	P38227	689 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	DFG10	P40526	253 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	DYN2	Q02647	92 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	YMR007W	Q03675	126 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	AVO2	Q04749	426 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	FRQ1	Q06389	190 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	MRL1	Q06815	381 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	RAD28	Q12021	506 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	ATP10	P18496	279 aa		6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	HSP10	P38910	106 aa		6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	SED1	Q01589	338 aa		6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	ERV2	Q12284	196 aa		6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	MIA40	P36046	403 aa		6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	YBR013C	P38215	129 aa		6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	BOR1	P53838	576 aa		6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	FYV6	P53913	173 aa		6.87	□□□□□ -1.31
GGA2	YHR108W	SOR2	Q07786	357 aa		6.87	□□□□□ -1.31

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