RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W BPH1P25356 2167 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W RPD3P32561 433 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W ATP3P38077 311 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W LSM4P40070 187 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YNL194CP40169 301 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W HXT14P42833 540 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W SNX4P47057 423 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YMR082CQ04276 118 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W AEP3Q12089 606 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YBR255C-AQ3E776 120 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W MSN1P22148 382 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YBR292CP38357 123 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YJL213WP40896 331 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W CAF40P53829 373 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YMR166CQ03829 368 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W HOF1Q05080 669 aa3.33□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W SHB17P36136 271 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W NSA2P40078 261 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YER137CP40083 148 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W CAF16P43569 289 aa3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W CWC25P53854 179 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W FRQ1Q06389 190 aa3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W FEX1Q08913 375 aa3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W AGC1Q12482 902 aa3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W NOP1P15646 327 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W GRX2P17695 143 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W SEC22P22214 214 aa3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W SIP1P32578 815 aa3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W DOG2P38773 246 aa3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W DOG1P38774 246 aa3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W SAS2P40963 338 aa3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YNR066CP53752 436 aa3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W ATG5Q12380 294 aa3.32□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W MIC12P38341 106 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YAR068WP39564 161 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W SPC25P40014 221 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W GPP2P40106 250 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W LST8P41318 303 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W AGX1P43567 385 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W BUL1P48524 976 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YGR219WP53307 113 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W HCH1P53834 153 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W FEX2Q08991 375 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W ATO3Q12359 275 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W QCR9P22289 66 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YNK1P36010 153 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W PEX7P39108 375 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W TAX4P47030 604 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W UBC12P52491 188 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YGR151CP53287 111 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W BOR1P53838 576 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W APJ1P53940 528 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W RRT7Q07829 113 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W JID1Q12350 301 aa3.31□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W EMP24P32803 203 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YBL071CP38185 102 aa3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YCL001W-AP87012 153 aa3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W SDH7Q04401 133 aa3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W PRM3Q08931 133 aa3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W COA2Q3E823 68 aa3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W CDS1P38221 457 aa3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W ICS2P38284 255 aa3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W VPS55P47111 140 aa3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YNL234WP53857 426 aa3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W DUG3P53871 357 aa3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W HOR7Q05827 59 aa3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W PRR2Q12310 699 aa3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YGR035W-AQ45U48 73 aa3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W URA2P07259 2214 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W COX2P00410 251 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W ECM25P32525 599 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YKR045CP36138 183 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W RRT1P38192 103 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W CSH1P38287 376 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W DFG10P40526 253 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W SMD3P43321 101 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W TAD2P47058 250 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W PLP1Q04004 230 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W MCH1Q07376 486 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YER190C-BP0CX94 160 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YEL077W-AP0CX95 160 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YGR296C-BP0CX96 160 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YPL283W-BP0CX97 160 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YPR204C-AP0CX98 160 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YFL068WP0CX99 160 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YLL066W-AP0CY00 160 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W YLL067W-AP0CY01 160 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W UPS2P35200 230 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W WSS1P38838 269 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W BDH1P39714 382 aa3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W AIR1P40507 360 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPC105YGL093W RIB4P50861 169 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 91.9 ms