RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	CAF40	P53829	373 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YNL234W	P53857	426 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SMP3	Q04174	516 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	TIM18	Q08749	192 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YOL114C	Q12322	202 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ATP4	P05626	244 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PET54	P10834	293 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PCL1	P24867	279 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	IFM1	P25038	676 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RHB1	P25378	209 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RER1	P25560	188 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PEX4	P29340	183 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	VPH2	P32341	215 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	QRI5	P32344	111 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RPB7	P34087	171 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	AST1	P35183	429 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MRPL10	P36520	322 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YBR063C	P38083	404 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RIB5	P38145	238 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	END3	P39013	349 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	NAS2	P40555	220 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	IGD1	P43598	195 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SPG1	P50088	95 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	BRR6	P53062	197 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YGL149W	P53116	101 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SDS23	P53172	527 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	CAX4	P53223	239 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	GPI1	P53306	609 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	HSK3	P69852	69 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MET31	Q03081	177 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YMR181C	Q03231	154 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	THI74	Q04083	370 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YMR082C	Q04276	118 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	GAL83	Q04739	417 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SPC3	Q12133	184 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ATG31	Q12421	196 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MRPL25	P23369	157 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YCR025C	P25352	136 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	IMP1	P28627	190 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	NUF2	P33895	451 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	FRM2	P37261	193 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	AVT6	P40074	448 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PAM16	P42949	149 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	FAR3	P46671	204 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	URB2	P47108	1174 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	AIM24	P47127	394 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SAY1	P53324	424 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	OCA2	P53949	197 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YNL033W	P53964	284 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	CAB5	Q03941	241 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	UPS3	Q04006	179 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MED4	Q12343	284 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	TRM10	Q12400	293 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PCL9	Q12477	304 aa		0.2	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	VPS63	O13549	108 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	VAR1	P02381	398 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	URA6	P15700	204 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	CPR2	P23285	205 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SEC66	P33754	206 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	IKI1	P38874	309 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MTW1	P39731	289 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YER135C	P40082	130 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DJP1	P40564	432 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MET28	P40573	187 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	FMP32	P43557	207 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DIE2	P50076	525 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YPS5	P53057	165 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YDR366C	P87287	132 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DML1	Q03652	475 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	FIT1	Q04433	528 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YLR173W	Q06247	608 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RRT7	Q07829	113 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YPR013C	Q12145	317 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RPN6	Q12377	434 aa		0.19	□□□□□ -2.38

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