RNA–Protein interactions for RNA: YMR228W

MTF1, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase specificity factor, yeast

Gene MTF1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTF1	YMR228W	TEM1	P38987	245 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	FAR7	P43592	221 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YJL028W	P47062	111 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YIP3	P53633	176 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	PEX11	Q12462	236 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	TRA1	P38811	3744 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	FES1	P38260	290 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	ECM14	P38836	430 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	MTW1	P39731	289 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	COG3	P40094	801 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	PRM8	P53174	237 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	GTR2	P53290	341 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	MSA1	Q08471	629 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	MDM32	Q12171	622 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	COX10	P21592	462 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	CAT5	P41735	233 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	ERV29	P53337	310 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	OSH6	Q02201	448 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	SNO1	Q03144	224 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	EMI1	Q04406	187 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	TIM22	Q12328	207 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	PST1	Q12355	444 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	SFC1	P33303	322 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	BDH1	P39714	382 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	AGC1	Q12482	902 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
MTF1	YMR228W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
MTF1	YMR228W	SEC22	P22214	214 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	NRK1	P53915	240 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YLR460C	P54007	376 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	HAL1	Q01766	294 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	SWC7	Q06707	132 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	OCA6	Q12454	224 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	QCR2	P07257	368 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	PUT1	P09368	476 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	DID2	P69771	204 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	ABF2	Q02486	183 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YMD8	Q03697	442 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YLR462W	O13556	202 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	PCL1	P24867	279 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	RNP1	P32385	249 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	YEL028W	P39989	153 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	YGR067C	P53243	804 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	TIM13	P53299	105 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	YNL140C	P53910	189 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	MRX8	Q05473	314 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	MRS1	P07266	363 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	CPT1	P17898	393 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	DOG2	P38773	246 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	DOG1	P38774	246 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	YFL012W	P43580	148 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	AME1	P38313	324 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	RMD6	P39975	231 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	YER121W	P40076	114 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	GRX8	Q05926	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	PRR2	Q12310	699 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	CUP2	P15315	225 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MTF1	YMR228W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.3 ms