RNA–Protein interactions for RNA: YMR031C

EIS1, Transcript of Component of the eisosome required for proper eisosome assembly, yeast

Gene EIS1, Length 2,532 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EIS1	YMR031C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	SIR2	P06700	562 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	FUN14	P18411	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	MKK1	P32490	508 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	SSS1	P35179	80 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
EIS1	YMR031C	YGL101W	P53144	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	ATP23	P53722	227 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	VPS28	Q02767	242 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	CPR3	P25719	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YMC1	P32331	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	MUP1	P50276	574 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	CSI2	Q08054	341 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YPS3	Q12303	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	PST1	Q12355	444 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	LAS17	Q12446	633 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	BNI1	P41832	1953 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	LSB5	P25369	354 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	KAR4	P25583	335 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YCK3	P39962	524 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	SNN1	P48232	102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YPL062W	Q02781	134 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	TEN1	Q07921	160 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	AIM39	Q08223	395 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	FDH1	Q08911	376 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	RFM1	Q12192	310 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	MET22	P32179	357 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	CPR7	P47103	393 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	HMS2	P47175	358 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	AAH1	P53909	347 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	PEX34	P25584	144 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	ATG15	P25641	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	PAN6	P40459	309 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YPR114W	Q06107	315 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	USO1	P25386	1790 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	RAS1	P01119	309 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YGL230C	P53074	147 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	MDM34	P53083	459 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	MCP1	Q12106	302 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	COX5B	P00425	151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	TEM1	P38987	245 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YPL073C	P40323	161 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	SIM1	P40472	476 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	RRT5	P43607	289 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YJR012C	P47087	207 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	DAN1	P47178	298 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YGR045C	P53229	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	MAK3	Q03503	176 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	ORT1	Q12375	292 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EIS1	YMR031C	ERS1	P17261	260 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	GAT3	Q07928	141 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	MCA1	Q08601	432 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	COX10	P21592	462 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	FAA2	P39518	744 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	YER134C	P40081	178 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	YIL059C	P40520	121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	OST2	P46964	130 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	YGR151C	P53287	111 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	MSA1	Q08471	629 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	IZH2	Q12442	317 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	TFS1	P14306	219 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	UBC5	P15732	148 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	YCR007C	P25354	239 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	TRS65	P32893	560 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	CTF8	P38877	133 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	SPC25	P40014	221 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	YFR054C	P43622	192 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	AIM25	P47140	327 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	BUD32	P53323	261 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	SDC1	Q03323	175 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EIS1	YMR031C	CDC43	P18898	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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