RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W RIO1Q12196 484 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W CKS1P20486 150 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W SCO1P23833 295 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W MGT1P26188 188 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W MED6P38782 295 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W JAC1P53193 184 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W EFM5P53200 248 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W ARR2Q06597 130 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W TSC3Q3E790 80 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W TIM9O74700 87 aa3.09□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W PET9P18239 318 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W ICE2P40499 491 aa3.09□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W ARP3P47117 449 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W ARO8P53090 500 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W NEJ1Q06148 342 aa3.09□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W QCR2P07257 368 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W MRPS28P21771 286 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W CLG1P35190 452 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W MRPL17P36528 281 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W FES1P38260 290 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W YKE4P40544 346 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W PRM10P42946 383 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W AIM34Q03673 198 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W YHR180WP38868 163 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W AIM2P39721 246 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W LSM4P40070 187 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W FMP32P43557 207 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W YLR031WQ07978 186 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W DGA1Q08650 418 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W ATO3Q12359 275 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W ATP15P21306 62 aa3.06□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W AHC2P25649 128 aa3.06□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W NVJ1P38881 321 aa3.06□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W PGD1P40356 397 aa3.06□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W YGR219WP53307 113 aa3.06□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W COS6P53344 381 aa3.06□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W MIX17Q03667 156 aa3.06□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W VPS68Q12016 184 aa3.06□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W PEX11Q12462 236 aa3.06□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W SEC14P24280 304 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W AME1P38313 324 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W SHH4Q06236 168 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W HRT1Q08273 121 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W FAB1P34756 2278 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W ARO7P32178 256 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W CLB6P32943 380 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W GVP36P40531 326 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W CIS3P47001 227 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W YDR274CP87283 123 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W YPR014CQ6B0W2 109 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W MEI4P29467 408 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W OCH1P31755 480 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR047WYKR047W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
YKR047WYKR047W FMP23P38231 175 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W OPY1P38271 328 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W UMP1P38293 148 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W AVT2P39981 480 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W SER2P42941 309 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W UBC6P33296 250 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W SNC2P33328 115 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W YKL102CP34249 101 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W YEA4P40004 342 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W EAF6P47128 113 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W PGA1P53896 198 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W MRPS8Q03799 155 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W GPI17Q04080 534 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W YOL014WQ08110 124 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W CMD1P06787 147 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W DOC1P53068 250 aa3□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W YGL235WP53071 178 aa3□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W YNR062CP53748 327 aa3□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W EMC6Q12431 108 aa3□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W YML100W-AQ8TGT0 57 aa3□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W YET1P35723 206 aa2.99□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W YOR062CP36025 268 aa2.99□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W ERV15P38312 142 aa2.99□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W YBR285WP38354 144 aa2.99□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W TDA4P47153 279 aa2.99□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W NUP49Q02199 472 aa2.99□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W PLP1Q04004 230 aa2.99□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W YOR342CQ12182 319 aa2.99□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W CPA1P07258 411 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W PEX4P29340 183 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 211.5 ms