RNA–Protein interactions for RNA: YKL211C

TRP3, Transcript of Indole-3-glycerol-phosphate synthase, yeast

Gene TRP3, Length 1,455 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRP3	YKL211C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	COX2	P00410	251 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	PDE1	P22434	369 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
TRP3	YKL211C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	MNL1	P38888	796 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	RNH201	P53942	307 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	SAM50	P53969	484 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	NRG1	Q03125	231 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	MSC3	Q05812	728 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	CSI2	Q08054	341 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	FRE7	Q12333	620 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	NPC2	Q12408	173 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRP3	YKL211C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	MRP49	P32388	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	MKK2	P32491	506 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	ZIM17	P42844	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	GIM5	Q04493	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	BSC6	Q08280	497 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	VPS68	Q12016	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	PRR2	Q12310	699 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	SAL1	D6W196	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	DAL82	P21705	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	QCR9	P22289	66 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	SPO13	P23624	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	YGL010W	P25338	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	MTC7	P32633	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	PRY2	P36110	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	NAS2	P40555	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	LST7	P53237	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	HOL1	P53389	586 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	HRT1	Q08273	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	AHT1	P29589	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	SPS18	P32572	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	DAD2	P36162	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	FRM2	P37261	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	ANS1	P38832	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	PIC2	P40035	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	GPI2	P46961	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	PDR17	P53844	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	YAP6	Q03935	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	UPS3	Q04006	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	ATG39	Q06159	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	LOA1	Q06508	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	STP4	Q07351	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	ENB1	Q08299	606 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	PIN2	Q12057	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	YDL157C	Q12082	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	RLM1	Q12224	676 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	SLO1	Q3E784	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	COA2	Q3E823	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	ATG40	Q99325	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	PAI3	P01094	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	STE18	P18852	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	CPR2	P23285	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	ERV1	P27882	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	GCS1	P35197	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	SNO3	P43544	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	RPA43	P46669	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	COQ5	P49017	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	YNR064C	P53750	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	DUG3	P53871	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	YML079W	Q03629	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	INP1	Q03694	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	IZH3	Q07959	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	YOR105W	Q08504	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	ISA2	Q12425	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	OPI3	P05375	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	YPT53	P36019	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRP3	YKL211C	YHL044W	P38727	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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