RNA–Protein interactions for RNA: YJL092W

SRS2, Transcript of DNA helicase and DNA-dependent ATPase, yeast

Gene SRS2, Length 3,525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRS2	YJL092W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	TFC1	P32367	649 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YND1	P40009	630 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YPL039W	Q03080	316 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	CNL1	Q06333	122 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	TSC3	Q3E790	80 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YBR063C	P38083	404 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	HHT1	P61830	136 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YMR244W	Q04018	355 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	POP4	P38336	279 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	HYM1	P32464	399 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	STB1	P42845	420 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YFR054C	P43622	192 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	FMP42	Q04991	504 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YPL162C	Q12042	273 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.37	□□□□□ -1.87	not detected
SRS2	YJL092W	PHO89	P38361	574 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	AVT6	P40074	448 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	FIP1	P45976	327 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YJL028W	P47062	111 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	TDA4	P47153	279 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	GAS3	Q03655	524 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	INP1	Q03694	420 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	JID1	Q12350	301 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	OST2	P46964	130 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YGR219W	P53307	113 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	DGK1	Q12382	290 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YLR462W	O13556	202 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	ZRT3	P34240	503 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	MSA2	P36157	363 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	GGC1	P38988	300 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YEL075C	P39972	122 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YGL262W	P53054	175 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	IZH2	Q12442	317 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	TIM17	P39515	158 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	FCY21	P40039	528 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	BOR1	P53838	576 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YDR366C	P87287	132 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	APS2	Q00381	147 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	VPS71	Q03433	280 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	ECM19	Q06011	112 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	SNM1	P40993	198 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	SYS1	P41544	203 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	MCP1	Q12106	302 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YPL247C	Q12523	523 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	SFC1	P33303	322 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YPT53	P36019	220 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	XPT1	P47165	209 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	BNR1	P40450	1375 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	PHO85	P17157	305 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	PTC1	P35182	281 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.34	□□□□□ -1.87	not detected
SRS2	YJL092W	YGR039W	P53225	103 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	ATO3	Q12359	275 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRS2	YJL092W	SDH3	P33421	198 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	YFL067W	P43537	175 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	NDD1	Q08887	554 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	YBL010C	P32788	280 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	MRPL17	P36528	281 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	CWC27	Q02770	301 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	NAT3	Q06504	195 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	YER181C	P40097	107 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	UFD1	P53044	361 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	IES3	Q12345	250 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	GEP5	Q12393	293 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	MDS3	P53094	1487 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	RPB9	P27999	122 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	SPT14	P32363	452 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	YHL026C	P38740	315 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SRS2	YJL092W	API2	Q04413	109 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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