RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W CTR3Q06686 241 aa3.36□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W PCL9Q12477 304 aa3.36□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YPR064WQ12492 139 aa3.36□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YCL012CQ8J0M4 134 aa3.36□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W SAL1D6W196 494 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W COX3P00420 269 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W TPI1P00942 248 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W PAU19P0CE85 124 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W PAU21P0CE86 164 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W PAU22P0CE87 164 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W LSB5P25369 354 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W PAU3P25610 124 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W ARO2P28777 376 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W RPL32P38061 130 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W GPI16P38875 610 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YEL057CP39983 233 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YJL068CP40363 299 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W MIC26P50087 233 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YGL204CP53089 101 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W LCL3P53153 274 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YGR015CP53208 328 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YGR126WP53274 230 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W PAU12P53343 120 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W DUG3P53871 357 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W DIA1P54005 336 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W ACT1P60010 375 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W ADD37Q03233 198 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YLR118CQ12354 227 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W ILV5P06168 395 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YPR170W-BP0C5R9 85 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W AFG1P32317 509 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W MKK1P32490 508 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YCR087C-AP37263 153 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W THI2P38141 450 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W RPF1P38805 295 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W MNL1P38888 796 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W TOS2P50078 622 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W THG1P53215 237 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W ROY1Q04847 553 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa3.35□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W CPA1P07258 411 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W LSM2P38203 95 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W FIG1P38224 298 aa3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W AVT7P40501 490 aa3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W RIB4P50861 169 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W AQR1P53943 586 aa3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W CRZ1P53968 678 aa3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YPL080CQ02826 108 aa3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YDR391CQ04170 232 aa3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W DIC1Q06143 298 aa3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YLR456WQ06199 204 aa3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W YCT1Q12235 531 aa3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
HCA4YJL033W QCR7P00128 127 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W TDH2P00358 332 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W MSW1P04803 379 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W NOP1P15646 327 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RPI1P23250 407 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W SLM5P25345 492 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YCR100CP25606 316 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W CWP1P28319 239 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W PAU2P32612 120 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W UTR5P32630 166 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W ECM34P38728 170 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YHR177WP38867 453 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W PFS1P38872 237 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W IRC22P40006 225 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W PCL7P40186 285 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RPA43P46669 326 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W TMA23Q03525 211 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W INP1Q03694 420 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YML018CQ03730 393 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W MCH1Q07376 486 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YLR030WQ07967 263 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YOR385WQ08909 290 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W SRL2Q12020 392 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W MES1P00958 751 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W UPS2P35200 230 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W FMP46P36141 133 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W MRPS9P38120 278 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W TRS20P38334 175 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W TRR2P38816 342 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W SPC25P40014 221 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W PAU5P43575 122 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W PET130P47065 347 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YGL262WP53054 175 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RCE1Q03530 315 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W CTS2Q06350 511 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W DAP1Q12091 152 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YOR015WQ12169 119 aa3.33□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YOR304C-AO14468 76 aa3.32□□□□□ -1.88
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