RNA–Protein interactions for RNA: YJL028W

YJL028W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YJL028W, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL028W	YJL028W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	ARO7	P32178	256 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	MIG1	P27705	504 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	NVJ1	P38881	321 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	SWP1	Q02795	286 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	ARR2	Q06597	130 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	MSW1	P04803	379 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	SCO1	P23833	295 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	AHC2	P25649	128 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	SCM4	P32564	187 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	FMP23	P38231	175 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	MED6	P38782	295 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	PRM10	P42946	383 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	FMP32	P43557	207 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	SNX4	P47057	423 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	YJR146W	P47174	117 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	AIM34	Q03673	198 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	TIM9	O74700	87 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	ATP15	P21306	62 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	MRPL17	P36528	281 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	SDH4	P37298	181 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	YHL026C	P38740	315 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	SPO73	P40031	143 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	MNN5	P46982	586 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	DSK2	P48510	373 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	AIF1	P52923	378 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	PRM7	Q12459	698 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	TSC3	Q3E790	80 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL028W	YJL028W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	SHH4	Q06236	168 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	SUE1	Q06524	206 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	YLR031W	Q07978	186 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	DGA1	Q08650	418 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	PEX11	Q12462	236 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	FAB1	P34756	2278 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	HSL1	P34244	1518 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	OCH1	P31755	480 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	YHR180W	P38868	163 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	SLM2	P53955	656 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	NUP49	Q02199	472 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	MHT1	Q12525	324 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	YKL102C	P34249	101 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	FIG1	P38224	298 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	MTW1	P39731	289 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	YJL144W	P47009	104 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	YGL235W	P53071	178 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	PGA1	P53896	198 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	GPI17	Q04080	534 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	NEJ1	Q06148	342 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	ECM5	Q03214	1411 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	MRPS28	P21771	286 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	DER1	P38307	211 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	SER2	P42941	309 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	YDR274C	P87283	123 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	VPS68	Q12016	184 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	MEI4	P29467	408 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	OPY1	P38271	328 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	AIM2	P39721	246 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	PGD1	P40356	397 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	YFH7	P43591	353 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	COS6	P53344	381 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	HSK3	P69852	69 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	YLR053C	Q12026	108 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	ATO3	Q12359	275 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	RDI1	Q12434	202 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	YEA4	P40004	342 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	TDA4	P47153	279 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	YGR219W	P53307	113 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	YOL014W	Q08110	124 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	NSL1	Q12143	216 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YJL028W	YJL028W	YPR096C	O13587	100 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YJL028W	YJL028W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YJL028W	YJL028W	TVP38	P36164	337 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YJL028W	YJL028W	UMP1	P38293	148 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YJL028W	YJL028W	DOC1	P53068	250 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YJL028W	YJL028W	PLP1	Q04004	230 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YJL028W	YJL028W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 78.5 ms