RNA–Protein interactions for RNA: YGL239C

YGL239C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGL239C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL239C	YGL239C	PET191	Q02772	108 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	RCE1	Q03530	315 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	JLP1	Q12358	412 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	SEY1	Q99287	776 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	TVP23	P38962	199 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	YNL194C	P40169	301 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	SOK1	P40317	901 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	MGA1	P53050	456 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	PDR17	P53844	350 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	YPL073C	P40323	161 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	FLX1	P40464	311 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	YMR007W	Q03675	126 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	YOL160W	Q08321	113 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YGL239C	YGL239C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	MER1	P16523	270 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	STE18	P18852	110 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	OTU1	P43558	301 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	IRC18	P47056	224 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	RAD17	P48581	401 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	COG5	P53951	403 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	COQ1	P18900	473 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	SPO13	P23624	291 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	SPS18	P32572	300 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	KDX1	P36005	433 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	TRM5	P38793	499 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YFL065C	P43539	102 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	MPC3	P53311	146 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	CWC27	Q02770	301 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	MDM32	Q12171	622 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	MDM35	O60200	86 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YHL042W	P38729	150 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YNG1	Q08465	219 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	DGA1	Q08650	418 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	AIM25	P47140	327 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	GET1	P53192	235 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	ODC2	Q99297	307 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YCL042W	P25572	119 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	ECM4	P36156	370 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YCR087C-A	P37263	153 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	MSS2	P40990	351 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YFH7	P43591	353 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	NCB2	Q92317	146 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	ARG80	P07249	177 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	OCH1	P31755	480 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YEL008W	P40001	126 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	AIM36	Q03798	255 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	YMR252C	Q04814	134 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	IRC23	Q08416	157 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YGL239C	YGL239C	TAF14	P35189	244 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YGL239C	YGL239C	IKI1	P38874	309 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YGL239C	YGL239C	YEA4	P40004	342 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YGL239C	YGL239C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YGL239C	YGL239C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YGL239C	YGL239C	FIT2	Q08906	153 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YGL239C	YGL239C	GIS3	Q12418	502 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YGL239C	YGL239C	COX8	P04039	78 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YGL239C	YGL239C	AIM2	P39721	246 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YGL239C	YGL239C	SER2	P42941	309 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YGL239C	YGL239C	YMR295C	Q03559	197 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YGL239C	YGL239C	FUS2	Q05670	677 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YGL239C	YGL239C	GGA1	Q06336	557 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YGL239C	YGL239C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 52.8 ms