RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	YMR320W	Q04897	101 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YKL102C	P34249	101 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	SFK1	P35735	353 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	UBP5	P39944	805 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	CAT5	P41735	233 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YGR050C	P53231	118 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	RNH201	P53942	307 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	TIM8	P57744	87 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	DID2	P69771	204 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	CDC7	P06243	507 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	PEX34	P25584	144 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	PRM5	P40476	318 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	BNS1	P50084	137 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YGL101W	P53144	215 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YGR015C	P53208	328 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YMD8	Q03697	442 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	DGA1	Q08650	418 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	KIN28	P06242	306 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	CPR4	P25334	318 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	OCH1	P31755	480 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YBR285W	P38354	144 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YHL044W	P38727	235 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	HPM1	P40481	377 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YJR015W	P47090	510 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	SHE1	P38200	338 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YEA4	P40004	342 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	HRD1	Q08109	551 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	APQ12	P40532	138 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	GLC8	P41818	229 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	TSA2	Q04120	196 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	SLO1	Q3E784	85 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YHI9	P38765	294 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	ATG18	P43601	500 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	SDT1	P53078	280 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	CRH1	P53301	507 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	ARL3	Q02804	198 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	ATP14	Q12349	124 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	PMD1	P32634	1753 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	MEP2	P41948	499 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YFL067W	P43537	175 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	MNN5	P46982	586 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	PGA1	P53896	198 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	PRR2	Q12310	699 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YOR304C-A	O14468	76 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	SMP1	P38128	452 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	FMP23	P38231	175 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	PHO89	P38361	574 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	MED6	P38782	295 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YIL012W	P40551	113 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	COS10	P52924	374 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	SDH7	Q04401	133 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YDR278C	Q05612	105 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	SPO13	P23624	291 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YER186C	P40101	306 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	FMP48	P53233	369 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	WSC2	P53832	503 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	IES4	Q08561	116 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YOR376W	Q08900	122 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YPR011C	Q12251	326 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	ERG2	P32352	222 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	STB1	P42845	420 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	FMN1	Q03778	218 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	MRX8	Q05473	314 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	JID1	Q12350	301 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	CCH1	P50077	2039 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	PDR18	P53756	1333 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	CSE2	P33308	149 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YER189W	P40104	122 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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