RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371417.3

ARRDC1-AS1-201, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,409 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PLCB2Q00722 1185 aa23.52■■□□□ 1.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TAP1Q03518 808 aa23.52■■□□□ 1.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.52■■□□□ 1.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SV2CQ496J9 727 aa23.52■■□□□ 1.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.52■■□□□ 1.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SPRED2Q7Z698 418 aa23.52■■□□□ 1.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.52■■□□□ 1.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.52■■□□□ 1.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SPG21Q9NZD8 308 aa23.52■■□□□ 1.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PAX3P23760 479 aa23.51■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PON1P27169 355 aa23.51■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WDR72Q3MJ13 1102 aa23.51■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TIGD5Q53EQ6 642 aa23.51■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WDR44Q5JSH3 913 aa23.51■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TRIM65Q6PJ69 517 aa23.51■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ERGIC2Q96RQ1 377 aa23.51■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FSD2A1L4K1 749 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 I3L4J1 428 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CBFA2T2O43439 604 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CLSTN1O94985 981 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DNAJB2P25686 324 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CTNNB1P35222 781 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PPM1AP35813 382 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LRMPQ12912 555 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SYCP1Q15431 976 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PTPN21Q16825 1174 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PLVAPQ9BX97 442 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GDAP2Q9NXN4 497 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EFEMP2O95967 443 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ERVK-21P61565 698 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FUT10Q6P4F1 479 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DSTYKQ6XUX3 929 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TATDN2Q93075 761 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TMEM169Q96HH4 297 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SENP8Q96LD8 212 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SAMD11Q96NU1 681 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GPR62Q9BZJ7 368 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SNX9Q9Y5X1 595 aa23.5■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.358e-6■■■■■ 107
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 M0QZQ0 153 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FGF18O76093 207 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KLK7P49862 253 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PLCB3Q01970 1234 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 APBA1Q02410 837 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TIFAQ96CG3 184 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SUSD3Q96L08 255 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NT5C1BQ96P26 610 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TRIM5Q9C035 493 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SIX2Q9NPC8 291 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 POLIQ9UNA4 740 aa23.49■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LAMA3Q16787 3333 aa23.48■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 A0A1W2PQC6 194 aa23.48■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CYB561D2O14569 222 aa23.48■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TRAPPC3O43617 180 aa23.48■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RB1P06400 928 aa23.48■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TPM3P06753 285 aa23.48■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TNNC1P63316 161 aa23.48■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.48■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.48■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PBX1P40424 430 aa23.47■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ASPAP45381 313 aa23.47■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ARHGEF19Q8IW93 802 aa23.47■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.47■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.47■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 APEX2Q9UBZ4 518 aa23.47■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PCDHB8Q9UN66 801 aa23.47■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HUS1O60921 280 aa23.46■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 P4HA1P13674 534 aa23.46■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KRT17Q04695 432 aa23.46■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GSE1Q14687 1217 aa23.46■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SOWAHAQ2M3V2 549 aa23.46■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.46■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.46■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LIMS2Q7Z4I7 341 aa23.46■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TOP6BLQ8N6T0 577 aa23.46■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.46■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MMS19Q96T76 1030 aa23.46■■□□□ 1.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CERS4Q9HA82 394 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms