Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SNX9Q9Y5X1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SNX9Q9Y5X1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SNX9Q9Y5X1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SNX9Q9Y5X1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SNX9Q9Y5X1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SNX9Q9Y5X1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SNX9Q9Y5X1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SNX9Q9Y5X1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SNX9Q9Y5X1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SNX9Q9Y5X1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SNX9Q9Y5X1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SNX9Q9Y5X1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SNX9Q9Y5X1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SNX9Q9Y5X1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SNX9Q9Y5X1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SNX9Q9Y5X1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SNX9Q9Y5X1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SNX9Q9Y5X1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNX9Q9Y5X1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SNX9Q9Y5X1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SNX9Q9Y5X1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNX9Q9Y5X1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SNX9Q9Y5X1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SNX9Q9Y5X1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SNX9Q9Y5X1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SNX9Q9Y5X1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SNX9Q9Y5X1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SNX9Q9Y5X1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SNX9Q9Y5X1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SNX9Q9Y5X1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SNX9Q9Y5X1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SNX9Q9Y5X1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SNX9Q9Y5X1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SNX9Q9Y5X1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SNX9Q9Y5X1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SNX9Q9Y5X1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
SNX9Q9Y5X1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNX9Q9Y5X1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SNX9Q9Y5X1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SNX9Q9Y5X1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SNX9Q9Y5X1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SNX9Q9Y5X1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SNX9Q9Y5X1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SNX9Q9Y5X1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SNX9Q9Y5X1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SNX9Q9Y5X1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SNX9Q9Y5X1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SNX9Q9Y5X1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SNX9Q9Y5X1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SNX9Q9Y5X1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SNX9Q9Y5X1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SNX9Q9Y5X1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SNX9Q9Y5X1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SNX9Q9Y5X1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SNX9Q9Y5X1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SNX9Q9Y5X1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SNX9Q9Y5X1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SNX9Q9Y5X1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SNX9Q9Y5X1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SNX9Q9Y5X1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SNX9Q9Y5X1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
SNX9Q9Y5X1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SNX9Q9Y5X1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SNX9Q9Y5X1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SNX9Q9Y5X1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SNX9Q9Y5X1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SNX9Q9Y5X1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SNX9Q9Y5X1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SNX9Q9Y5X1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SNX9Q9Y5X1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SNX9Q9Y5X1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SNX9Q9Y5X1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SNX9Q9Y5X1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SNX9Q9Y5X1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SNX9Q9Y5X1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SNX9Q9Y5X1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SNX9Q9Y5X1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SNX9Q9Y5X1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SNX9Q9Y5X1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SNX9Q9Y5X1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SNX9Q9Y5X1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SNX9Q9Y5X1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SNX9Q9Y5X1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SNX9Q9Y5X1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
SNX9Q9Y5X1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SNX9Q9Y5X1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SNX9Q9Y5X1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SNX9Q9Y5X1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SNX9Q9Y5X1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SNX9Q9Y5X1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SNX9Q9Y5X1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SNX9Q9Y5X1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SNX9Q9Y5X1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX9Q9Y5X1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX9Q9Y5X1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX9Q9Y5X1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNX9Q9Y5X1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SNX9Q9Y5X1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SNX9Q9Y5X1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms