RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	LSB6	P42951	607 aa		3.81	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	EMP47	P43555	445 aa		3.81	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		3.81	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	ISF1	P32488	338 aa		3.8	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	IRE1	P32361	1115 aa		3.79	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	MRPL16	P38064	232 aa		3.79	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	MRX12	P47084	519 aa		3.79	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	MCA1	Q08601	432 aa		3.79	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	SUM1	P46676	1062 aa		3.78	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	YDR215C	Q12240	137 aa		3.78	□□□□□ -1.8
snR46	snR46	JJJ2	P46997	583 aa		3.77	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	STB3	Q12427	513 aa		3.77	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	CSE4	P36012	229 aa		3.76	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	PRY1	P47032	299 aa		3.75	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	MCM16	Q12262	181 aa		3.74	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	KIN1	P13185	1064 aa		3.73	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	YBL036C	P38197	257 aa		3.73	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	SOH1	P38633	127 aa		3.73	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	SLX8	P40072	274 aa		3.73	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	ATG3	P40344	310 aa		3.73	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	HDA3	Q06623	655 aa		3.73	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	PSH1	Q12161	406 aa		3.73	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	SPR3	P41901	512 aa		3.72	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	YPL034W	Q03083	165 aa		3.72	□□□□□ -1.81
snR46	snR46	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	OMA1	P36163	345 aa		3.71	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	APL6	P46682	809 aa		3.71	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	TFB3	Q03290	321 aa		3.7	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	YTA6	P40328	754 aa		3.69	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	IRC24	P40580	263 aa		3.68	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	HPC2	Q01448	625 aa		3.68	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.68	□□□□□ -1.82	not detected
snR46	snR46	NHA1	Q99271	985 aa		3.68	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	YPP1	P46951	817 aa		3.67	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	SWI5	P08153	709 aa		3.66	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.66	□□□□□ -1.82	not detected
snR46	snR46	ALG14	P38242	237 aa		3.66	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	BRL1	P38770	471 aa		3.66	□□□□□ -1.82
snR46	snR46	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	RGP1	P16664	663 aa		3.64	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	BUD9	P53226	547 aa		3.64	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	MSC7	P38694	644 aa		3.63	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	INP52	P50942	1183 aa		3.63	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	YPQ2	Q06328	317 aa		3.63	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	YFL034W	P43564	1073 aa		3.62	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	AVT1	P47082	602 aa		3.62	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	YNL108C	P53929	270 aa		3.62	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	HEH2	Q03281	663 aa		3.62	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		3.62	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	NTH2	P35172	780 aa		3.61	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	ALD2	P47771	506 aa		3.61	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	MTO1	P53070	669 aa		3.61	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	YNL165W	P53891	406 aa		3.61	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	MLF3	P32047	452 aa		3.6	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	RRM3	P38766	723 aa		3.6	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	SAC7	P17121	654 aa		3.59	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	PKC1	P24583	1151 aa		3.59	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	COQ2	P32378	372 aa		3.59	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	GAS5	Q08193	484 aa		3.59	□□□□□ -1.83
snR46	snR46	AI3	P03877	415 aa		3.58	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	MCM1	P11746	286 aa		3.58	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	PRK1	P40494	810 aa		3.58	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	BIO2	P32451	375 aa		3.57	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	LIP5	P32875	414 aa		3.57	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	KAE1	P36132	386 aa		3.57	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	MED7	Q08278	222 aa		3.57	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	GIS4	Q04233	774 aa		3.56	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	TRP3	P00937	484 aa		3.54	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	YJL007C	P47080	104 aa		3.54	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	TSC13	Q99190	310 aa		3.54	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	CYT1	P07143	309 aa		3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.1 ms