RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A TBS1P38114 1094 aa6.15□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A HDA3Q06623 655 aa6.15□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-DR3Q12441 440 aa6.15□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A SBE2P42223 864 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A YPP1P46951 817 aa6.14□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A MSN5P52918 1224 aa6.13□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A RDS2P19541 446 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A CEM1P39525 442 aa6.12□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A SLX8P40072 274 aa6.12□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A RIM21P48565 533 aa6.12□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A UTP13Q05946 817 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data6.12□□□□□ -1.43not detected
YMR001C-AYMR001C-A YPR053CQ6Q5F3 151 aa6.12□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A BIM1P40013 344 aa6.11□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A ATG3P40344 310 aa6.11□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A ATG32P40458 529 aa6.11□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A ALA1P40825 983 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A SUM1P46676 1062 aa6.11□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A UBP15P50101 1230 aa6.11□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A SKN7P38889 622 aa6.1□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A SYT1Q06836 1226 aa6.1□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A AHP1P38013 176 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A TDA6Q06466 467 aa6.09□□□□□ -1.43
YMR001C-AYMR001C-A SHM1P37292 490 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A ENO1P00924 437 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A TIF1P10081 395 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A DIT1P21623 536 aa6.07□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A MRX10Q05648 414 aa6.07□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A SBP1P10080 294 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A JJJ2P46997 583 aa6.06□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A KRE33P53914 1056 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A ADE12P80210 433 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A SWI5P08153 709 aa6.05□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A IRE1P32361 1115 aa6.05□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A RTG2P32608 588 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A AIM9P40053 627 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A YMR187CQ03236 431 aa6.04□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A YCK2P23292 546 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
YMR001C-AYMR001C-A RPS31P05759 152 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A RPL34BP40525 121 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A YPQ2Q06328 317 aa6.02□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A PSH1Q12161 406 aa6.02□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A PDI1P17967 522 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A PDC6P26263 563 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A NTH2P35172 780 aa6.01□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A YDR461C-AQ2V2P7 80 aa6□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A MRPL16P38064 232 aa5.99□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A KTR7P40504 517 aa5.99□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A PEP12P32854 288 aa5.98□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A YNL165WP53891 406 aa5.98□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A MCX1P38323 520 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A HGH1P48362 394 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A STB3Q12427 513 aa5.97□□□□□ -1.45
YMR001C-AYMR001C-A YFL034WP43564 1073 aa5.96□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A TSC13Q99190 310 aa5.96□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A FPS1P23900 669 aa5.95□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A YNR014WP53719 212 aa5.95□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A YDR215CQ12240 137 aa5.95□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A AMN1P38285 549 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A MCA1Q08601 432 aa5.94□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A GPM1P00950 247 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A LEO1P38439 464 aa5.93□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A SPR3P41901 512 aa5.93□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A ACS2P52910 683 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A Q0182Q9ZZW1 134 aa5.93□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A CYT1P07143 309 aa5.92□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A MLF3P32047 452 aa5.92□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A ALD2P47771 506 aa5.92□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A LEU1P07264 779 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A MCM1P11746 286 aa5.91□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A BOI2P39969 1040 aa5.9□□□□□ -1.46
YMR001C-AYMR001C-A PHO87P25360 923 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR001C-AYMR001C-A DMA2P53924 522 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR001C-AYMR001C-A RGP1P16664 663 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR001C-AYMR001C-A YTA6P40328 754 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YMR001C-AYMR001C-A LSB6P42951 607 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR001C-AYMR001C-A PDC5P16467 563 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YMR001C-AYMR001C-A MSC7P38694 644 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR001C-AYMR001C-A HAP4P14064 554 aa5.85□□□□□ -1.47
YMR001C-AYMR001C-A ROM1P53046 1155 aa5.85□□□□□ -1.47
YMR001C-AYMR001C-A MTO1P53070 669 aa5.85□□□□□ -1.47
YMR001C-AYMR001C-A GAL2P13181 574 aa5.84□□□□□ -1.47
YMR001C-AYMR001C-A KNS1P32350 737 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A PRY1P47032 299 aa5.83□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A GAS4Q08271 471 aa5.83□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A TTI1P36097 1038 aa5.82□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A TGL4P36165 910 aa5.82□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A HXT5P38695 592 aa5.82□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A ECM23Q02710 187 aa5.82□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A UBP1P25037 809 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A NGR1P32831 672 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A SIS2P36024 562 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A MET1P36150 593 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A TAT1P38085 619 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.9 ms