RNA–Protein interactions for RNA: YLL054C

YLL054C, Transcript of Putative protein of unknown function with similarity to Pip2p, yeast

Gene YLL054C, Length 2,532 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL054C	YLL054C	UTR2	P32623	467 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	TBS1	P38114	1094 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	BOI2	P39969	1040 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	SUM1	P46676	1062 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	LEU3	P08638	886 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	JJJ2	P46997	583 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	YDR215C	Q12240	137 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	IRE1	P32361	1115 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	ATG3	P40344	310 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLL054C	YLL054C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	EMP47	P43555	445 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	LSB6	P42951	607 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	MCM16	Q12262	181 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	MRPL16	P38064	232 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	TAT1	P38085	619 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	SLX8	P40072	274 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	SPR3	P41901	512 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	YPP1	P46951	817 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	PSH1	Q12161	406 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	KIN1	P13185	1064 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	MAC1	P35192	417 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	HPC2	Q01448	625 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	HDA3	Q06623	655 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	STB3	Q12427	513 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	MCA1	Q08601	432 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	YPL034W	Q03083	165 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	YPQ2	Q06328	317 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	ISF1	P32488	338 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	DMA2	P53924	522 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YLL054C	YLL054C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	MCM1	P11746	286 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	YBL036C	P38197	257 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	IRC24	P40580	263 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	TFB3	Q03290	321 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	SOH1	P38633	127 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	MSC7	P38694	644 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	HEH2	Q03281	663 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	INP52	P50942	1183 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	NHA1	Q99271	985 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	YFL034W	P43564	1073 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	SWI5	P08153	709 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	RGP1	P16664	663 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	BRL1	P38770	471 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	YTA6	P40328	754 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	PRY1	P47032	299 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	ALD2	P47771	506 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.63	□□□□□ -1.99	not detected
YLL054C	YLL054C	OMA1	P36163	345 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	BUD9	P53226	547 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	AI3	P03877	415 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	ALG14	P38242	237 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.6	□□□□□ -1.99	not detected
YLL054C	YLL054C	SKP1	P52286	194 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	SAC7	P17121	654 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	SFA1	P32771	386 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	RIM21	P48565	533 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	YNL165W	P53891	406 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	GIS4	Q04233	774 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YLL054C	YLL054C	SLP1	Q12232	587 aa		2.59	□□□□□ -2
YLL054C	YLL054C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YLL054C	YLL054C	MLF3	P32047	452 aa		2.58	□□□□□ -2
YLL054C	YLL054C	BIO2	P32451	375 aa		2.58	□□□□□ -2
YLL054C	YLL054C	PRK1	P40494	810 aa		2.58	□□□□□ -2
YLL054C	YLL054C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YLL054C	YLL054C	TSC13	Q99190	310 aa		2.58	□□□□□ -2
YLL054C	YLL054C	NTH2	P35172	780 aa		2.57	□□□□□ -2
YLL054C	YLL054C	MED7	Q08278	222 aa		2.57	□□□□□ -2
YLL054C	YLL054C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		2.57	□□□□□ -2
YLL054C	YLL054C	AOS1	Q06624	347 aa		2.57	□□□□□ -2
YLL054C	YLL054C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48 ms