RNA–Protein interactions for RNA: YKL036C

YKL036C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL036C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL036CYKL036C SLI15P38283 698 aa23.11■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C PEX21P50091 288 aa23.1■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C SAS4Q04003 481 aa23.1■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C FRD1P32614 470 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C ATG20Q07528 640 aa23.09■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C SRT1Q03175 343 aa23.08■■□□□ 1.29
YKL036CYKL036C SSA4P22202 642 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
YKL036CYKL036C CST6P40535 587 aa23.05■■□□□ 1.28
YKL036CYKL036C SWI1P09547 1314 aa23.05■■□□□ 1.28
YKL036CYKL036C YDR306CQ06640 478 aa23.02■■□□□ 1.28
YKL036CYKL036C RET1P22276 1149 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
YKL036CYKL036C PUS5Q06244 254 aa23.01■■□□□ 1.27
YKL036CYKL036C RRD1P40454 393 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
YKL036CYKL036C MRP7P12687 371 aa22.99■■□□□ 1.27
YKL036CYKL036C YJR008WP47085 338 aa22.99■■□□□ 1.27
YKL036CYKL036C FCP1Q03254 732 aa22.99■■□□□ 1.27
YKL036CYKL036C RPP0P05317 312 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
YKL036CYKL036C NUP133P36161 1157 aa22.98■■□□□ 1.27
YKL036CYKL036C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
YKL036CYKL036C THS1P04801 734 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
YKL036CYKL036C FAS2P19097 1887 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
YKL036CYKL036C DPL1Q05567 589 aa22.92■■□□□ 1.26
YKL036CYKL036C SUI2P20459 304 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
YKL036CYKL036C RTG2P32608 588 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
YKL036CYKL036C HKR1P41809 1802 aa22.9■■□□□ 1.26
YKL036CYKL036C MSM1P22438 575 aa22.9■■□□□ 1.26
YKL036CYKL036C YLR278CQ05854 1341 aa22.88■■□□□ 1.25
YKL036CYKL036C SET1P38827 1080 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
YKL036CYKL036C VPS27P40343 622 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
YKL036CYKL036C DPH6Q12429 685 aa22.88■■□□□ 1.25
YKL036CYKL036C ITC1P53125 1264 aa22.87■■□□□ 1.25
YKL036CYKL036C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
YKL036CYKL036C NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
YKL036CYKL036C PSH1Q12161 406 aa22.84■■□□□ 1.25
YKL036CYKL036C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data22.83■■□□□ 1.25not detected
YKL036CYKL036C SAC3P46674 1301 aa22.82■■□□□ 1.24
YKL036CYKL036C ICP55P40051 511 aa22.82■■□□□ 1.24
YKL036CYKL036C YGR122WP53272 402 aa22.82■■□□□ 1.24
YKL036CYKL036C KRE2P27809 442 aa22.81■■□□□ 1.24
YKL036CYKL036C UBX2Q04228 584 aa22.81■■□□□ 1.24
YKL036CYKL036C GLC3P32775 704 aa22.79■■□□□ 1.24
YKL036CYKL036C TRP5P00931 707 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
YKL036CYKL036C FET4P40988 552 aa22.78■■□□□ 1.24
YKL036CYKL036C SET4P42948 560 aa22.78■■□□□ 1.24
YKL036CYKL036C CDC45Q08032 650 aa22.78■■□□□ 1.24
YKL036CYKL036C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
YKL036CYKL036C TIM50Q02776 476 aa22.77■■□□□ 1.24
YKL036CYKL036C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C MTC5Q03897 1148 aa22.76■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C FIG2P25653 1609 aa22.75■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C SUP35P05453 685 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C SWC3P31376 625 aa22.75■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C RAD24P32641 659 aa22.75■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C YPP1P46951 817 aa22.75■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C RPT4P53549 437 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C AIM7Q12156 149 aa22.74■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C NGR1P32831 672 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C VHR2P40041 505 aa22.73■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C MGM1P32266 881 aa22.72■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C UBP12P39538 1254 aa22.72■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C TRM44Q02648 567 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C THI3Q07471 609 aa22.72■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
YKL036CYKL036C SPL2P38839 148 aa22.7■■□□□ 1.22
YKL036CYKL036C GAS5Q08193 484 aa22.7■■□□□ 1.22
YKL036CYKL036C CRF1Q04930 467 aa22.69■■□□□ 1.22
YKL036CYKL036C AFG2P32794 780 aa22.68■■□□□ 1.22
YKL036CYKL036C BOI2P39969 1040 aa22.66■■□□□ 1.22
YKL036CYKL036C CSI1Q04368 295 aa22.66■■□□□ 1.22
YKL036CYKL036C SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
YKL036CYKL036C RVB2Q12464 471 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
YKL036CYKL036C YGR117CP53270 476 aa22.65■■□□□ 1.22
YKL036CYKL036C SRC1Q03707 834 aa22.65■■□□□ 1.22
YKL036CYKL036C VPS4P52917 437 aa22.64■■□□□ 1.21
YKL036CYKL036C EMP47P43555 445 aa22.63■■□□□ 1.21
YKL036CYKL036C GSM1P42950 618 aa22.62■■□□□ 1.21
YKL036CYKL036C HXT10P43581 546 aa22.61■■□□□ 1.21
YKL036CYKL036C YRB30P53107 440 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
YKL036CYKL036C RPS19AP07280 144 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
YKL036CYKL036C RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
YKL036CYKL036C HPR1P17629 752 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
YKL036CYKL036C PEA2P40091 420 aa22.59■■□□□ 1.21
YKL036CYKL036C PRP42Q03776 544 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
YKL036CYKL036C STV1P37296 890 aa22.58■■□□□ 1.21
YKL036CYKL036C YIL089WP40500 205 aa22.57■■□□□ 1.2
YKL036CYKL036C SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
YKL036CYKL036C IRC4Q03036 179 aa22.57■■□□□ 1.2
YKL036CYKL036C NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data22.57■■□□□ 1.2not detected
YKL036CYKL036C NUG1P40010 520 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
YKL036CYKL036C LCB1P25045 558 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
YKL036CYKL036C DAL5P15365 543 aa22.52■■□□□ 1.2
YKL036CYKL036C CWC15Q03772 175 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
YKL036CYKL036C ADR1P07248 1323 aa22.52■■□□□ 1.2
YKL036CYKL036C TOM1Q03280 3268 aa22.51■■□□□ 1.19
YKL036CYKL036C YIL092WP40497 633 aa22.51■■□□□ 1.19
YKL036CYKL036C TOS4Q06266 489 aa22.51■■□□□ 1.19
YKL036CYKL036C PSF3Q12146 194 aa22.51■■□□□ 1.19
YKL036CYKL036C FLO11P08640 1367 aa22.5■■□□□ 1.19
YKL036CYKL036C DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
YKL036CYKL036C ETP1P38748 585 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.9 ms