RNA–Protein interactions for RNA: YKL006C-A

SFT1, Transcript of Intra-Golgi v-SNARE, yeast

Gene SFT1, Length 294 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFT1	YKL006C-A	SUM1	P46676	1062 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SFT1	YKL006C-A	TTI1	P36097	1038 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SFT1	YKL006C-A	SSN3	P39073	555 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SFT1	YKL006C-A	RGA1	P39083	1007 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SFT1	YKL006C-A	MSN5	P52918	1224 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SFT1	YKL006C-A	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SFT1	YKL006C-A	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SFT1	YKL006C-A	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SFT1	YKL006C-A	VTC4	P47075	721 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SFT1	YKL006C-A	CPS1	P27614	576 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SFT1	YKL006C-A	ROG3	P43602	733 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SFT1	YKL006C-A	HAP4	P14064	554 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	PHO87	P25360	923 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	GAL2	P13181	574 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	TGL4	P36165	910 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	ECM23	Q02710	187 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	RLF2	Q12495	606 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	CYT1	P07143	309 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	UBP15	P50101	1230 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	IRE1	P32361	1115 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	SLA1	P32790	1244 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	JJJ2	P46997	583 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	YGR035C	P53222	116 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	GAS4	Q08271	471 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SFT1	YKL006C-A	UBX7	P38349	436 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	HPF1	Q05164	967 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	YPQ2	Q06328	317 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	VAN1	P23642	535 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	ROM1	P53046	1155 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	CUZ1	P53899	274 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	CCP1	P00431	361 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	PUP1	P25043	261 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	YTA6	P40328	754 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	MCM1	P11746	286 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	TRK2	P28584	889 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	CEM1	P39525	442 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	LYS5	P50113	272 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	CWH41	P53008	833 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	DIT1	P21623	536 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	PSH1	Q12161	406 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	DPH6	Q12429	685 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	TRS33	Q99394	268 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SFT1	YKL006C-A	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	MRPL16	P38064	232 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	YNL165W	P53891	406 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	UBP1	P25037	809 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	MLF3	P32047	452 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	YML083C	Q04526	418 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	STB3	Q12427	513 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	PUN1	Q06991	263 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	FPS1	P23900	669 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	SCD5	P34758	872 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	MTO1	P53070	669 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	SYT1	Q06836	1226 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
SFT1	YKL006C-A	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	RGP1	P16664	663 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	HXT5	P38695	592 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	SPR3	P41901	512 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	JJJ3	P47138	172 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	SUV3	P32580	737 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	KAP122	P32767	1081 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	ALD2	P47771	506 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	SRS2	P12954	1174 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	YBR197C	P38306	217 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	QDR2	P40474	542 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	CAB1	Q04430	367 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	THI72	Q08579	599 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFT1	YKL006C-A	RGA2	Q06407	1009 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SFT1	YKL006C-A	AI1	P03875	834 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SFT1	YKL006C-A	MRPL33	P20084	86 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SFT1	YKL006C-A	ISC10	P32645	267 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SFT1	YKL006C-A	RRN6	P32786	894 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SFT1	YKL006C-A	PNP1	Q05788	311 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SFT1	YKL006C-A	VMA3	P25515	160 aa		6	□□□□□ -1.45
SFT1	YKL006C-A	MDJ1	P35191	511 aa		6	□□□□□ -1.45
SFT1	YKL006C-A	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
SFT1	YKL006C-A	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45

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