RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A UBP1P25037 809 aa4.39□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A NTH2P35172 780 aa4.39□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A SUM1P46676 1062 aa4.39□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A MSN5P52918 1224 aa4.39□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A SCW11P53189 542 aa4.39□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A ECM23Q02710 187 aa4.39□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A SUB2Q07478 446 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A TCB1Q12466 1186 aa4.39□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A CYT1P07143 309 aa4.38□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A MCM1P11746 286 aa4.38□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A UTP7P40055 554 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A DAL1P32375 460 aa4.37□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A AHP1P38013 176 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A ROM1P53046 1155 aa4.37□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A YPQ2Q06328 317 aa4.37□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A NOB1Q08444 459 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A VAN1P23642 535 aa4.36□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A GAR1P28007 205 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A UBX7P38349 436 aa4.36□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A SSN3P39073 555 aa4.36□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A ALA1P40825 983 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A TY1A-BLQ12266 440 aa4.36□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A TRS33Q99394 268 aa4.36□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data4.35□□□□□ -1.71not detected
RPC10YHR143W-A JJJ2P46997 583 aa4.35□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A CDC19P00549 500 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A SSA1P10591 642 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A OSH7P38755 437 aa4.34□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A CWH41P53008 833 aa4.34□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A PUF6Q04373 656 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A YML083CQ04526 418 aa4.34□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A SLA1P32790 1244 aa4.33□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A NGR1P32831 672 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A ACO2P39533 789 aa4.33□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A UBP15P50101 1230 aa4.33□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A SCD5P34758 872 aa4.32□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A CAF120P53836 1060 aa4.32□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A TY1A-DR3Q12441 440 aa4.32□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A IRE1P32361 1115 aa4.31□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A SHM1P37292 490 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A ROG3P43602 733 aa4.31□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A TY1A-MR1Q04215 440 aa4.31□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A UTP4Q06679 776 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A YTA6P40328 754 aa4.3□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A YIR007WP40566 764 aa4.3□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A YDL176WQ12027 708 aa4.3□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A SRS2P12954 1174 aa4.29□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A PDC6P26263 563 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A SUV3P32580 737 aa4.29□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A GEF1P37020 779 aa4.29□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A HXT5P38695 592 aa4.29□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A NAM8Q00539 523 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A CWC15Q03772 175 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A PUN1Q06991 263 aa4.29□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A RPS31P05759 152 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A RGA1P39083 1007 aa4.28□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A ALD4P46367 519 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A CAB1Q04430 367 aa4.28□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A PSH1Q12161 406 aa4.28□□□□□ -1.72
RPC10YHR143W-A CCP1P00431 361 aa4.27□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A LEU1P07264 779 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A MLF3P32047 452 aa4.27□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A YNL165WP53891 406 aa4.27□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A YPL062WQ02781 134 aa4.27□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A Q0182Q9ZZW1 134 aa4.27□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A FOX2Q02207 900 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A PNP1Q05788 311 aa4.26□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A DIT1P21623 536 aa4.25□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A TPS3P38426 1054 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A ALD2P47771 506 aa4.25□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A CUZ1P53899 274 aa4.25□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A MRPL33P20084 86 aa4.24□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A CDC3P32457 520 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A RRN6P32786 894 aa4.24□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A YBR197CP38306 217 aa4.24□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A CEM1P39525 442 aa4.24□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A LYS5P50113 272 aa4.24□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A STB3Q12427 513 aa4.24□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A YDR461C-AQ2V2P7 80 aa4.24□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A FUR4P05316 633 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A RGP1P16664 663 aa4.23□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A ISC10P32645 267 aa4.23□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A MRPL16P38064 232 aa4.23□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A MTO1P53070 669 aa4.23□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A YGR035CP53222 116 aa4.23□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A DPH6Q12429 685 aa4.23□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A VMA3P25515 160 aa4.22□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A KAP122P32767 1081 aa4.22□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A DYS1P38791 387 aa4.22□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A KRE33P53914 1056 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RPC10YHR143W-A RPC31P17890 251 aa4.21□□□□□ -1.74
RPC10YHR143W-A QDR2P40474 542 aa4.21□□□□□ -1.74
RPC10YHR143W-A JJJ3P47138 172 aa4.21□□□□□ -1.74
RPC10YHR143W-A SKP1P52286 194 aa4.21□□□□□ -1.74
RPC10YHR143W-A KAR5Q04746 504 aa4.21□□□□□ -1.74
RPC10YHR143W-A HPF1Q05164 967 aa4.21□□□□□ -1.74
RPC10YHR143W-A SYT1Q06836 1226 aa4.21□□□□□ -1.74
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