RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	AI2	P03876	854 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	HSE1	P38753	452 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	YOR378W	Q08902	515 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	CEX1	Q12453	761 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	RAD51	P25454	400 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	RTF1	P53064	558 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	PEX8	P53248	589 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	VTI1	Q04338	217 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	MNL2	Q12205	849 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	CLN2	P20438	545 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	ANP1	P32629	500 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	RCR1	P38212	213 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	NUP82	P40368	713 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	YLR352W	Q06479	807 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	YPR172W	Q06608	200 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	MPH2	P0CD99	609 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	MPH3	P0CE00	602 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	EMP47	P43555	445 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	YJR107W	P47145	328 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	SPC19	Q03954	165 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	ERO1	Q03103	563 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	BDF2	Q07442	638 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	HOM3	P10869	527 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	NPR3	P38742	1146 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	MDJ2	P42834	146 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	VPS16	Q03308	798 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	IRC3	Q06683	689 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	COQ8	P27697	501 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	CWC24	P53769	259 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	ECM23	Q02710	187 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	YNL058C	P53947	316 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	RRI2	Q12348	645 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	CHD1	P32657	1468 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	PHO8	P11491	566 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	PEX5	P35056	612 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	RXT2	P38255	430 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	APE4	P38821	490 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	SRB7	P47822	140 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	RSC2	Q06488	889 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	APC5	Q08683	685 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	PIN2	Q12057	282 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	RTP1	Q12751	981 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	PET111	P08468	800 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	YKL222C	P35995	705 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	PAF1	P38351	445 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	YHR218W	P38899	603 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	MXR1	P40029	184 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	FYV10	P40492	516 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	KEL2	P50090	882 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	RSC1	P53236	928 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	SSH4	P32343	579 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	HIR1	P32479	840 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	PEX6	P33760	1030 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	CSE4	P36012	229 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	BTN2	P53286	410 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SET1	YHR119W	THI4	P32318	326 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	PEP7	P32609	515 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	KTR7	P40504	517 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	TEA1	P47988	759 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	HUL5	P53119	910 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	UBX7	P38349	436 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	NIT1	P40447	199 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	RIA1	P53893	1110 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	YLR125W	Q12138	136 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	MSB4	Q12317	492 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	ADR1	P07248	1323 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	ATP4	P05626	244 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	MCM1	P11746	286 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	MRM1	P25270	412 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	TPD3	P31383	635 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	CAJ1	P39101	391 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	NDE1	P40215	560 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	VTC3	Q02725	835 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	SND1	Q04007	877 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.7 ms