RNA–Protein interactions for RNA: YGL239C

YGL239C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGL239C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL239C	YGL239C	GAL2	P13181	574 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	PHO87	P25360	923 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	SCW11	P53189	542 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	UBP2	Q01476	1272 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	HAP4	P14064	554 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	PUP1	P25043	261 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	TAF7	Q05021	590 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	UBX7	P38349	436 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	SUM1	P46676	1062 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	CYT1	P07143	309 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	SSN3	P39073	555 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	CAF120	P53836	1060 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	YML083C	Q04526	418 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	YDL176W	Q12027	708 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	DAL1	P32375	460 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	OSH7	P38755	437 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	MSN5	P52918	1224 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	ROM1	P53046	1155 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	GAS4	Q08271	471 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	VAN1	P23642	535 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	VTC4	P47075	721 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	YIR007W	P40566	764 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	JJJ2	P46997	583 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	YPQ2	Q06328	317 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	IRE1	P32361	1115 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	SLA1	P32790	1244 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	ACO2	P39533	789 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	ROG3	P43602	733 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	TRS33	Q99394	268 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	MCM1	P11746	286 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	UBP1	P25037	809 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	UBP15	P50101	1230 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	CWH41	P53008	833 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	YNL165W	P53891	406 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	PUN1	Q06991	263 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	MLF3	P32047	452 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
YGL239C	YGL239C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	SUV3	P32580	737 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	YTA6	P40328	754 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.83	□□□□□ -1.8	not detected
YGL239C	YGL239C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	PSH1	Q12161	406 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	CCP1	P00431	361 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	CUZ1	P53899	274 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	SCD5	P34758	872 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	MRPL16	P38064	232 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	HXT5	P38695	592 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	STB3	Q12427	513 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	SRS2	P12954	1174 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	DIT1	P21623	536 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	CEM1	P39525	442 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	MTO1	P53070	669 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	YGR035C	P53222	116 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	CAB1	Q04430	367 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	HPF1	Q05164	967 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	TRK2	P28584	889 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	ISC10	P32645	267 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	YBR197C	P38306	217 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	ALD2	P47771	506 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	PNP1	Q05788	311 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	RGP1	P16664	663 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	GEF1	P37020	779 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	QDR2	P40474	542 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YGL239C	YGL239C	MRPL33	P20084	86 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	VMA3	P25515	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	KAP122	P32767	1081 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	RRN6	P32786	894 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	LYS5	P50113	272 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	FPS1	P23900	669 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	SPR3	P41901	512 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	SYT1	Q06836	1226 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	BOL3	P39724	118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81

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