RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	SLY41	P22215	453 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	ISF1	P32488	338 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	FUI1	P38196	639 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	NUP82	P40368	713 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	PPM2	Q08282	695 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	RTF1	P53064	558 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	HUL5	P53119	910 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	MNR2	P35724	969 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	COG4	Q06096	861 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	GPI13	Q07830	1017 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	MRC1	P25588	1096 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	PAF1	P38351	445 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	DAK2	P43550	591 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	LSO1	Q3E827	93 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.11	□□□□□ -1.59	not detected
SYF1	YDR416W	NST1	P53935	1240 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	TRS120	Q04183	1289 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	HIF1	Q12373	385 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	MET5	P47169	1442 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	PEP7	P32609	515 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	GAS4	Q08271	471 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	DPB3	P27344	201 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	FOL1	P53848	824 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	PHO8	P11491	566 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	CWC24	P53769	259 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	TFB4	Q12004	338 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	LTE1	P07866	1435 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	RAD27	P26793	382 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	SPR3	P41901	512 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	DNF1	P32660	1571 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	SRM1	P21827	482 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	TIM23	P32897	222 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	PET112	P33893	541 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	ATG3	P40344	310 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	PEX8	P53248	589 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	TSC13	Q99190	310 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	YNL115C	P53925	644 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	YLR125W	Q12138	136 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	SAM3	Q08986	587 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	BNI1	P41832	1953 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	CYC8	P14922	966 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	VAN1	P23642	535 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	YGR122W	P53272	402 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	PUS6	P53294	404 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	PIB1	Q06651	286 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	FRA1	Q07825	749 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	YOR378W	Q08902	515 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	ENT2	Q05785	613 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	TRS33	Q99394	268 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	RAD4	P14736	754 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	RPN12	P32496	274 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	IES1	P43579	692 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	GDE1	Q02979	1223 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	MPH3	P0CE00	602 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	APL6	P46682	809 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	AI4	P03878	556 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	VPS35	P34110	944 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	SPO20	Q04359	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	IRC20	Q06554	1556 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	GYP5	Q12344	894 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	THI4	P32318	326 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	TIM54	P47045	478 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	YGR021W	P53212	290 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected

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