RNA–Protein interactions for RNA: YBL008W-A

YBL008W-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YBL008W-A, Length 240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL008W-AYBL008W-A MRPL16P38064 232 aa5.12□□□□□ -1.59
YBL008W-AYBL008W-A FRA1Q07825 749 aa5.11□□□□□ -1.59
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
YBL008W-AYBL008W-A DAT1P13483 248 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YBL008W-AYBL008W-A TPS3P38426 1054 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YBL008W-AYBL008W-A IRE1P32361 1115 aa5.08□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A JJJ2P46997 583 aa5.08□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A SPT2P06843 333 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A UTP7P40055 554 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A BUD9P53226 547 aa5.07□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A STB3Q12427 513 aa5.07□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A UTR2P32623 467 aa5.06□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A ALA1P40825 983 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A SHM1P37292 490 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A SPR3P41901 512 aa5.05□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A RAD59Q12223 238 aa5.05□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A SUM1P46676 1062 aa5.04□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A STE20Q03497 939 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A AOS1Q06624 347 aa5.04□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A PSH1Q12161 406 aa5.04□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A PDC6P26263 563 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
YBL008W-AYBL008W-A ISR1Q06098 443 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
YBL008W-AYBL008W-A PGM1P33401 570 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
YBL008W-AYBL008W-A TBS1P38114 1094 aa5.01□□□□□ -1.61
YBL008W-AYBL008W-A MSC7P38694 644 aa5□□□□□ -1.61
YBL008W-AYBL008W-A NHA1Q99271 985 aa5□□□□□ -1.61
YBL008W-AYBL008W-A ELM1P32801 640 aa4.99□□□□□ -1.61
YBL008W-AYBL008W-A MAK16P10962 306 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
YBL008W-AYBL008W-A YKR073CP36153 106 aa4.98□□□□□ -1.61
YBL008W-AYBL008W-A MED7Q08278 222 aa4.98□□□□□ -1.61
YBL008W-AYBL008W-A SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
YBL008W-AYBL008W-A AI3P03877 415 aa4.97□□□□□ -1.61
YBL008W-AYBL008W-A PGM2P37012 569 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
YBL008W-AYBL008W-A CSN12P47130 423 aa4.97□□□□□ -1.61
YBL008W-AYBL008W-A TRP3P00937 484 aa4.96□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A LIP5P32875 414 aa4.96□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A ALG14P38242 237 aa4.96□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A RPS31P05759 152 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A GLC3P32775 704 aa4.94□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A SAC7P17121 654 aa4.93□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A APL6P46682 809 aa4.93□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A GAS5Q08193 484 aa4.93□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A LEU1P07264 779 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A HAL5P38970 855 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A SLX8P40072 274 aa4.92□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A CTH1P47976 325 aa4.92□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A KAE1P36132 386 aa4.91□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A UBP5P39944 805 aa4.91□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A MRX12P47084 519 aa4.91□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A ARI1P53111 347 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
YBL008W-AYBL008W-A COQ2P32378 372 aa4.9□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data4.9□□□□□ -1.63not detected
YBL008W-AYBL008W-A TOS1P38288 455 aa4.9□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A YNR021WP53723 404 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A RGP1P16664 663 aa4.88□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A NAR1P23503 491 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A EMP47P43555 445 aa4.88□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A ALD2P47771 506 aa4.88□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A YLR122CQ12312 125 aa4.88□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A ISF1P32488 338 aa4.87□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A RRM3P38766 723 aa4.87□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A GIS1Q03833 894 aa4.86□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A GIS4Q04233 774 aa4.86□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A BRE4Q07660 1125 aa4.86□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A SFA1P32771 386 aa4.85□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A PRK1P40494 810 aa4.85□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A HEH2Q03281 663 aa4.84□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A YPQ2Q06328 317 aa4.84□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A HDA3Q06623 655 aa4.84□□□□□ -1.63
YBL008W-AYBL008W-A NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data4.83□□□□□ -1.64not detected
YBL008W-AYBL008W-A RNQ1P25367 405 aa4.82□□□□□ -1.64
YBL008W-AYBL008W-A HPC2Q01448 625 aa4.82□□□□□ -1.64
YBL008W-AYBL008W-A MCM16Q12262 181 aa4.82□□□□□ -1.64
YBL008W-AYBL008W-A YGR130CP53278 816 aa4.81□□□□□ -1.64
YBL008W-AYBL008W-A YCR015CP25616 317 aa4.8□□□□□ -1.64
YBL008W-AYBL008W-A YNL165WP53891 406 aa4.8□□□□□ -1.64
YBL008W-AYBL008W-A MAG2Q06436 670 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
YBL008W-AYBL008W-A AIM7Q12156 149 aa4.79□□□□□ -1.64
YBL008W-AYBL008W-A NGR1P32831 672 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
YBL008W-AYBL008W-A YKL222CP35995 705 aa4.78□□□□□ -1.64
YBL008W-AYBL008W-A SAF1P38352 637 aa4.78□□□□□ -1.64
YBL008W-AYBL008W-A SOH1P38633 127 aa4.78□□□□□ -1.64
YBL008W-AYBL008W-A YTA6P40328 754 aa4.78□□□□□ -1.64
YBL008W-AYBL008W-A CHS2P14180 963 aa4.77□□□□□ -1.65
YBL008W-AYBL008W-A RSC6P25632 483 aa4.76□□□□□ -1.65
YBL008W-AYBL008W-A UTP13Q05946 817 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
YBL008W-AYBL008W-A SWI5P08153 709 aa4.74□□□□□ -1.65
YBL008W-AYBL008W-A TFB3Q03290 321 aa4.74□□□□□ -1.65
YBL008W-AYBL008W-A CYC7P00045 113 aa4.73□□□□□ -1.65
YBL008W-AYBL008W-A MLF3P32047 452 aa4.73□□□□□ -1.65
YBL008W-AYBL008W-A SSA2P10592 639 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YBL008W-AYBL008W-A CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data4.72□□□□□ -1.65not detected
YBL008W-AYBL008W-A MCM1P11746 286 aa4.71□□□□□ -1.66
YBL008W-AYBL008W-A NCL1P38205 684 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
YBL008W-AYBL008W-A ATG3P40344 310 aa4.71□□□□□ -1.66
YBL008W-AYBL008W-A SEG2P34250 1132 aa4.7□□□□□ -1.66
YBL008W-AYBL008W-A CSE4P36012 229 aa4.7□□□□□ -1.66
YBL008W-AYBL008W-A SPO74P45819 413 aa4.7□□□□□ -1.66
YBL008W-AYBL008W-A PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data4.7□□□□□ -1.66not detected
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.9 ms