RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614476.4

MTERF4-222, Transcript of mitochondrial transcription termination factor 4, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MTERF4, Length 4,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTERF4-222	ENST00000614476		E9PSI1	815 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	NUP160	Q12769	1436 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	NGEF	Q8N5V2	710 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	SKAP1	Q86WV1	359 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	AAMP	Q13685	434 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	10.81	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	STK26	Q9P289	416 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	TPM2	P07951	284 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	TRAK2	O60296	914 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	COG6	Q9Y2V7	657 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MTERF4-222	ENST00000614476	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	PDE3A	Q14432	1141 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	C8orf34	Q49A92	452 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	MCM4	P33991	863 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	APAF1	O14727	1248 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		10.75	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		10.75	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	CLCN1	P35523	988 aa		10.75	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	ESPN	B1AK53	854 aa		10.74	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		10.74	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		10.74	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		10.74	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	CEP170	Q5SW79	1584 aa		10.74	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		10.74	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	PLEKHG5	O94827	1062 aa		10.74	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	10.74	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		10.74	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	EVC2	Q86UK5	1308 aa		10.73	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		10.73	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		10.73	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	ADGRL2	O95490	1459 aa		10.73	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		10.73	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	PPP2R1A	P30153	589 aa		10.73	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		10.73	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	ZMYND15	Q9H091	742 aa		10.73	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	MAP7D2	Q96T17	732 aa		10.72	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	SLFN5	Q08AF3	891 aa		10.72	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		10.72	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	PZP	P20742	1482 aa		10.72	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		10.72	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		10.71	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	CFAP44	Q96MT7	982 aa		10.71	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	PLCH2	O75038	1416 aa		10.71	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	PANK1	Q8TE04	598 aa		10.71	□□□□□ -0.69
MTERF4-222	ENST00000614476	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		10.71	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	BCAR3	O75815	825 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	10.7	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	INSR	P06213	1382 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	CASC1	Q6TDU7	716 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	ADGRL1	O94910	1474 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	FANCA	O15360	1455 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MTERF4-222	ENST00000614476	ABCC2	Q92887	1545 aa		10.66	□□□□□ -0.7

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