RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 DIP2AQ14689 1571 aa25.8■■□□□ 1.72
HERC3-214ENST00000601319 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.8■■□□□ 1.72
HERC3-214ENST00000601319 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.78■■□□□ 1.72
HERC3-214ENST00000601319 TRIM52Q96A61 297 aa25.77■■□□□ 1.72
HERC3-214ENST00000601319 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
HERC3-214ENST00000601319 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
HERC3-214ENST00000601319 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.75■■□□□ 1.71
HERC3-214ENST00000601319 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
HERC3-214ENST00000601319 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
HERC3-214ENST00000601319 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
HERC3-214ENST00000601319 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.73■■□□□ 1.71
HERC3-214ENST00000601319 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
HERC3-214ENST00000601319 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
HERC3-214ENST00000601319 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.72■■□□□ 1.71
HERC3-214ENST00000601319 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.71■■□□□ 1.71
HERC3-214ENST00000601319 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
HERC3-214ENST00000601319 ALKQ9UM73 1620 aa25.7■■□□□ 1.7
HERC3-214ENST00000601319 PPLO60437 1756 aa25.68■■□□□ 1.7
HERC3-214ENST00000601319 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.68■■□□□ 1.7
HERC3-214ENST00000601319 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.67■■□□□ 1.7
HERC3-214ENST00000601319 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.66■■□□□ 1.7
HERC3-214ENST00000601319 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.65■■□□□ 1.7
HERC3-214ENST00000601319 KCNA6P17658 529 aa25.64■■□□□ 1.7
HERC3-214ENST00000601319 IFT172Q9UG01 1749 aa25.63■■□□□ 1.69
HERC3-214ENST00000601319 PIK3R4Q99570 1358 aa25.63■■□□□ 1.69
HERC3-214ENST00000601319 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.62■■□□□ 1.69
HERC3-214ENST00000601319 TBX22Q9Y458 520 aa25.62■■□□□ 1.69
HERC3-214ENST00000601319 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HERC3-214ENST00000601319 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
HERC3-214ENST00000601319 BCANQ96GW7 911 aa25.6■■□□□ 1.69
HERC3-214ENST00000601319 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.6■■□□□ 1.69
HERC3-214ENST00000601319 TOM1O60784 492 aa25.59■■□□□ 1.69
HERC3-214ENST00000601319 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
HERC3-214ENST00000601319 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
HERC3-214ENST00000601319 TMEM94Q12767 1356 aa25.56■■□□□ 1.68
HERC3-214ENST00000601319 FOXD1Q16676 465 aa25.55■■□□□ 1.68
HERC3-214ENST00000601319 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.54■■□□□ 1.68
HERC3-214ENST00000601319 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.53■■□□□ 1.68
HERC3-214ENST00000601319 HRCP23327 699 aa25.52■■□□□ 1.68
HERC3-214ENST00000601319 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.51■■□□□ 1.67
HERC3-214ENST00000601319 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HERC3-214ENST00000601319 PTPRUQ92729 1446 aa25.48■■□□□ 1.67
HERC3-214ENST00000601319 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
HERC3-214ENST00000601319 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
HERC3-214ENST00000601319 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
HERC3-214ENST00000601319 PIP4K2BP78356 416 aa25.45■■□□□ 1.66
HERC3-214ENST00000601319 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.44■■□□□ 1.66
HERC3-214ENST00000601319 METP08581 1390 aa25.44■■□□□ 1.66
HERC3-214ENST00000601319 MSH6P52701 1360 aa25.44■■□□□ 1.66
HERC3-214ENST00000601319 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
HERC3-214ENST00000601319 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.42■■□□□ 1.66
HERC3-214ENST00000601319 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.42■■□□□ 1.66
HERC3-214ENST00000601319 LAMC1P11047 1609 aa25.4■■□□□ 1.66
HERC3-214ENST00000601319 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.4■■□□□ 1.66
HERC3-214ENST00000601319 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.39■■□□□ 1.66
HERC3-214ENST00000601319 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.38■■□□□ 1.65
HERC3-214ENST00000601319 MYOM2P54296 1465 aa25.38■■□□□ 1.65
HERC3-214ENST00000601319 PTCH1Q13635 1447 aa25.37■■□□□ 1.65
HERC3-214ENST00000601319 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
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HERC3-214ENST00000601319 DCCP43146 1447 aa25.37■■□□□ 1.65
HERC3-214ENST00000601319 HSPA1LP34931 641 aa25.36■■□□□ 1.65
HERC3-214ENST00000601319 PIK3C2GO75747 1445 aa25.36■■□□□ 1.65
HERC3-214ENST00000601319 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.35■■□□□ 1.65
HERC3-214ENST00000601319 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.32■■□□□ 1.64
HERC3-214ENST00000601319 RGL3Q3MIN7 710 aa25.31■■□□□ 1.64
HERC3-214ENST00000601319 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.31■■□□□ 1.64
HERC3-214ENST00000601319 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.3■■□□□ 1.64
HERC3-214ENST00000601319 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.29■■□□□ 1.64
HERC3-214ENST00000601319 PHLPP1O60346 1717 aa25.28■■□□□ 1.64
HERC3-214ENST00000601319 C14orf37Q86TY3 774 aa25.27■■□□□ 1.64
HERC3-214ENST00000601319 TECPR2O15040 1411 aa25.27■■□□□ 1.64
HERC3-214ENST00000601319 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HERC3-214ENST00000601319 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.26■■□□□ 1.63
HERC3-214ENST00000601319 SLAIN2Q9P270 581 aa25.26■■□□□ 1.63
HERC3-214ENST00000601319 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.24■■□□□ 1.63
HERC3-214ENST00000601319 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HERC3-214ENST00000601319 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HERC3-214ENST00000601319 ATF3P18847 181 aa25.22■■□□□ 1.63
HERC3-214ENST00000601319 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.22■■□□□ 1.63
HERC3-214ENST00000601319 MST1RQ04912 1400 aa25.2■■□□□ 1.63
HERC3-214ENST00000601319 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
HERC3-214ENST00000601319 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.2■■□□□ 1.62
HERC3-214ENST00000601319 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.18■■□□□ 1.62
HERC3-214ENST00000601319 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HERC3-214ENST00000601319 ABCC11Q96J66 1382 aa25.17■■□□□ 1.62
HERC3-214ENST00000601319 ADGRB1O14514 1584 aa25.15■■□□□ 1.62
HERC3-214ENST00000601319 STAC3Q96MF2 364 aa25.15■■□□□ 1.62
HERC3-214ENST00000601319 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
HERC3-214ENST00000601319 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.14■■□□□ 1.61
HERC3-214ENST00000601319 SHPRHQ149N8 1683 aa25.13■■□□□ 1.61
HERC3-214ENST00000601319 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HERC3-214ENST00000601319 DLC1Q96QB1 1528 aa25.12■■□□□ 1.61
HERC3-214ENST00000601319 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.11■■□□□ 1.61
HERC3-214ENST00000601319 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.09■■□□□ 1.61
HERC3-214ENST00000601319 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.08■■□□□ 1.61
HERC3-214ENST00000601319 BRINP3Q76B58 766 aa25.08■■□□□ 1.61
HERC3-214ENST00000601319 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.07■■□□□ 1.6
HERC3-214ENST00000601319 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.07■■□□□ 1.6
HERC3-214ENST00000601319 SIRT1Q96EB6 747 aa25.06■■□□□ 1.6
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